ഇതാണ് BIRAP എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പ്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് Sample_Files.zip ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക്‌സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
BIRAP എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് OnWorks-ൽ സൗജന്യമായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ
Ad
ബിരാപ്
വിവരണം
BIRAP (ബാക്ടീരിയൽ ഇന്റർജെനിക് റീജിയൻ അനാലിസിസ് പൈപ്പ്ലൈൻ) ഒരു ഓപ്പൺ സോഴ്‌സാണ്, ഇത് ഉപയോഗിക്കാൻ എളുപ്പമുള്ള പേൾ പൈപ്പ്ലൈൻ ആണ്, ഇത് പരീക്ഷണാത്മക ഡാറ്റ ഉപയോഗിച്ച് ബാക്ടീരിയൽ ജീനോമുകൾ വീണ്ടും വ്യാഖ്യാനിക്കാൻ ഉപയോഗിക്കാം. ഉപകരണം RNA-seq കൂടാതെ/അല്ലെങ്കിൽ പ്രോട്ടിയോജെനോമിക്‌സിൽ നിന്ന് ഉരുത്തിരിഞ്ഞ എക്‌സ്‌പ്രഷൻ പ്രൊഫൈൽ സമന്വയിപ്പിക്കുന്നു, നിലവിലുള്ള സിലിക്കോ വ്യാഖ്യാനവുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്തുന്നു, വ്യാഖ്യാനത്തെ സാധൂകരിക്കാനും നോവൽ പ്രോട്ടീൻ കോഡിംഗ് മേഖലകൾ തിരിച്ചറിയാനും നോൺ-കോഡിംഗ് ആർ‌എൻ‌എയെ സഹായിക്കാനും നിലവിലുള്ള വ്യാഖ്യാനത്തിലെ പിശകുകൾ ശരിയാക്കാനും സഹായിക്കുന്നു. . പൈപ്പ്ലൈനിന് RNA-seq ഡാറ്റയ്‌ക്കായി SAMtools-ൽ നിന്നുള്ള “പൈലപ്പ്” ഔട്ട്‌പുട്ടും പ്രോട്ടീജെനോമിക് മാപ്പിംഗ് ടൂളിൽ നിന്നുള്ള പെപ്‌റ്റൈഡ്/ePST ലോക്കസ് ഫയലും (GFF) പ്രോട്ടീജെനോമിക്സ് ഡാറ്റയ്‌ക്കുള്ള ജിനോമിനൊപ്പം സിലിക്കോ വ്യാഖ്യാനത്തിൽ നിലവിലുള്ളതും ആവശ്യമാണ്. ജീനോമിലെ (.coords ഫോർമാറ്റിൽ) പ്രൊമോട്ടർമാരുടെയും ടെർമിനേറ്ററുകളുടെയും സ്ഥാനം സംബന്ധിച്ച വിവരങ്ങൾ നൽകുമ്പോൾ, കോഡിംഗ് അല്ലാത്ത RNA തിരിച്ചറിയാനും പൈപ്പ്ലൈൻ സഹായിക്കും.
സവിശേഷതകൾ
- ബാക്ടീരിയൽ ജീനോമുകളുടെ ഇന്റർജെനിക് മേഖല വിശകലനം
- ബാക്ടീരിയൽ ജീനോമുകളുടെ പുനർ വ്യാഖ്യാനം
- ചെറിയ RNA (sRNA) കണ്ടെത്തൽ
- RNA-seq
- പ്രോട്ടോജെനോമിക്സ്
പ്രേക്ഷകർ
ശാസ്ത്രം/ഗവേഷണം
ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്
കൺസോൾ/ടെർമിനൽ, കമാൻഡ്-ലൈൻ
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
പേൾ
Categories
ഇത് https://sourceforge.net/projects/birap/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
