ഇതാണ് CStone എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പ്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് cstone.zip ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക് സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
CStone എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് OnWorks-നൊപ്പം സൗജന്യമായി ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ
Ad
CStone
വിവരണം
RNA-Seq ഡാറ്റയ്‌ക്കായുള്ള ഒരു ഡി നോവോ അസംബ്ലറാണ് CStone, അത് ഗ്രാഫുകൾ പോലെയുള്ള de Bruijn ഉപയോഗിക്കുകയും മൂന്ന് ഗ്രാഫ് ക്ലാസിഫിക്കേഷൻ ലെവലുകൾ ഉപയോഗിച്ച് നിർമ്മിച്ച ഓരോ കോണ്ടിഗും വ്യാഖ്യാനിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു, അത് ചിമെറിക് അല്ലെന്ന് ഉറപ്പുനൽകാൻ കഴിയുമോ ഇല്ലയോ എന്ന് സൂചിപ്പിക്കുന്നു. വർഗ്ഗീകരണ നിലകൾ റീഡുകൾ ഉരുത്തിരിഞ്ഞ ജീൻ കുടുംബത്തിന്റെ സങ്കീർണ്ണതയെ ആശ്രയിച്ചിരിക്കുന്നു. ഒരു ഉപോൽപ്പന്നമെന്ന നിലയിൽ, ക്രമീകരിച്ചിരിക്കുന്ന അന്തർലീനമായ ജീൻ കുടുംബങ്ങളുടെ ഘടനാപരമായ ഘടനയെക്കുറിച്ചുള്ള ഉൾക്കാഴ്ചയും ഇത് നൽകുന്നു. കൂടുതൽ വിശദാംശങ്ങൾ ഞങ്ങളുടെ പേപ്പറിൽ ഉടൻ ലഭ്യമാകും: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34813594/.
സവിശേഷതകൾ
- RNA-Seq ഡാറ്റയുടെ ഡി നോവോ അസംബ്ലി.
- നോൺ-ചൈമറിക് കോണ്ടിഗുകളുടെ തിരിച്ചറിയൽ.
- ക്രോസ്-പ്ലാറ്റ്ഫോം അനുയോജ്യത.
- എക്സിക്യൂട്ടബിൾ ജാർ ലഭ്യമാണ്.
- ബാഹ്യ പാക്കേജുകൾ ആവശ്യമില്ല.
- പിന്തുടരാൻ എളുപ്പമുള്ള കോഡ് മറ്റ് ഉപകരണങ്ങളിലേക്ക് സംയോജിപ്പിച്ചിരിക്കുന്നു.
- അന്തർലീനമായ ജീൻ കുടുംബങ്ങളുടെ സങ്കീർണ്ണതയെക്കുറിച്ചുള്ള വിവരങ്ങൾ.
- de Bruijn പോലെ (കൂടുതൽ സൗമ്യമായ) സമീപനം.
ഇത് https://sourceforge.net/projects/cstone/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
