ലിനക്സിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിക്കാനുള്ള miRDP2 എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പാണിത്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് miRDP2-v1.1.4.tar.gz ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക് സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
OnWorks-ൽ സൗജന്യമായി Linux-ൽ പ്രവർത്തിക്കാൻ miRDP2 എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
miRDP2 ഓൺലൈനിൽ Linux-ൽ പ്രവർത്തിക്കും
Ad
വിവരണം
miRDeep-P2 (miRDP2) വികസിപ്പിച്ചെടുത്തത് സസ്യങ്ങളിലെ മൈക്രോആർഎൻഎ (miRNAs) ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിനെ കൃത്യമായും വേഗത്തിലും വിശകലനം ചെയ്യുന്നതിനാണ്. ഇത് miRDeep-P (miRDP) ൽ നിന്ന് പുതിയ തന്ത്രങ്ങളും ഓവർഹോൾഡ് അൽഗോരിതവും ഉപയോഗിച്ച് സ്വീകരിച്ചു. അറബിഡോപ്സിസ്, അരി, തക്കാളി, ചോളം, ഗോതമ്പ് എന്നിങ്ങനെ ക്രമേണ വർദ്ധിച്ച ജനിതക വലുപ്പമുള്ള അത്തരം സസ്യങ്ങളിലെ മൈആർഎൻഎ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമുകൾ വിശകലനം ചെയ്യാൻ ഞങ്ങൾ miRDP2 പരീക്ഷിച്ചു. miRDeep-P, മറ്റ് നിരവധി കമ്പ്യൂട്ടേഷണൽ ടൂളുകൾ എന്നിവയുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്തുമ്പോൾ, miRDP2 ഉയർന്ന വേഗതയിൽ NGS ഡാറ്റ പ്രോസസ്സ് ചെയ്തു. പുതുതായി അപ്ഡേറ്റ് ചെയ്ത പ്ലാന്റ് miRNA വ്യാഖ്യാന മാനദണ്ഡങ്ങൾ ഉൾപ്പെടുത്തുന്നതിലൂടെ, miRDP2 ന്റെ കൃത്യതയും ഗണ്യമായി മെച്ചപ്പെടുന്നു. സസ്യങ്ങളിലെ miRNA ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം വിശകലനം ചെയ്യുന്നതിനുള്ള വേഗതയേറിയതും കൃത്യവുമായ ഉപകരണമായി ഞങ്ങളുടെ ഫലങ്ങൾ miRDP2 തെളിയിക്കുന്നു.റഫറൻസ്: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty972
സവിശേഷതകൾ
- ചെറിയ RNA
- microRNA(miRNA)
- അടുത്ത തലമുറ സീക്വൻസിംഗ് (NGS)
- പേൾ
പ്രേക്ഷകർ
ശാസ്ത്രം/ഗവേഷണം
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
പേൾ
ഡാറ്റാബേസ് പരിസ്ഥിതി
പേൾ DBI/DBD
ഇത് https://sourceforge.net/projects/mirdp2/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്തിരിക്കുന്നു.