Ini ialah arahan bp_chaos_plotp yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS
JADUAL:
NAMA
bp_chaos_plot - plot huru-hara daripada urutan DNA dan RNA
SINOPSIS
bp_chaos_plot.pl -i/--input=INPUTFILE -f/--format=SEQFORMAT
-o/--output=OUTPUTFILE -g/--graphics=FORMAT GRAFIK
-w/--lebar=BERAT -h/--tinggi=TINGGI
DESCRIPTION
Skrip ini menjana fail imej menggunakan perpustakaan imej GD untuk menggambarkan nukleotida
urutan menggunakan plot huru-hara.
PILIHAN
Format grafik yang sah pada masa ini ialah gd, gd2, png, wbmp, jpeg dan gif.
Saiz lalai fail imej ialah 600x400.
Input jujukan boleh disediakan menggunakan mana-mana daripada tiga kaedah:
hujah yang tidak dinamakan
bp_chaos_plot nama fail
hujah bernama
bp_chaos_plot -i nama fail
input standard
bp_chaos_plot < nama fail
Maklum balas
Mailing senarai
Maklum balas pengguna adalah sebahagian daripada evolusi ini dan modul Bioperl yang lain. Hantar
komen dan cadangan anda sebaiknya ke senarai mel Bioperl. Penyertaan anda
amat dihargai.
[e-mel dilindungi] - Perbincangan umum
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - Mengenai senarai mel
laporan bugs
Laporkan pepijat kepada sistem penjejakan pepijat Bioperl untuk membantu kami menjejaki pepijat dan pepijatnya
resolusi. Laporan pepijat boleh diserahkan melalui web:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
AUTHOR - Jason Stajich
E-mel [e-mel dilindungi]
SEJARAH
Kod ini adalah berdasarkan kod EMBOSS C untuk chaos.c oleh Ian Longden. Termasuk ialah
dokumentasi daripada kod EMBOSS:
Kekacauan menghasilkan plot huru-hara. Aplikasi asal adalah sebahagian daripada genom ACEDB
pakej pangkalan data, ditulis oleh ** Richard Durbin (MRC LMB, UK) [e-mel dilindungi], dan
Jean Thierry-Mieg (CRBM du CNRS, Perancis) [e-mel dilindungi]
Gunakan bp_chaos_plotp dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
