Ini ialah arahan createChemistryHeader yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
createChemistryHeader.py - Buat pengepala SAM dengan kimia penjujukan PacBio
maklumat
DESCRIPTION
penggunaan: getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_files BAS_FILES
[BAS_FILES ...]
input_alignment_file output_header_file
createChemistryHeader mencipta pengepala SAM yang mengandungi maklumat kimia yang digunakan oleh
Bergetar.
kedudukannya hujah:
fail_penjajaran_input
Fail SAM atau BAM yang dihasilkan oleh BLSR.
output_header_file
Nama fail pengepala SAM atau BAM yang akan dibuat dengan maklumat kimia
dimuatkan.
pilihan hujah:
-h, - membantu
tunjukkan mesej bantuan ini dan keluar
--nyahpepijat
Keluarkan maklumat log terperinci. (lalai: Palsu)
--bas_files BAS_FILES [BAS_FILES ...]
Fail bas atau bax yang mengandungi bacaan yang diselaraskan dalam
fail_penjajaran_input. Juga boleh menjadi fofn fail bas atau bax. (lalai: Tiada)
Gunakan createChemistryHeader dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
