Ini ialah titik arahan yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
dotter - Susun titik titik dengan alat peningkatan imej.
SINOPSIS
dotter [pilihan] [Pilihan X]
DESCRIPTION
Rujukan: Sonnhammer ELL & Durbin R (1995). Program dot-matriks dengan dinamik
kawalan ambang yang sesuai untuk analisis jujukan DNA dan protein genomik. gen
167(2):GC1-10.
Jenis yang dibenarkan:
Protein - DNA Protein - DNA DNA -
Protein
Pilihan:
-b
Mod kelompok, tulis dotplot ke
-l
Muatkan dotplot daripada
-m
Had penggunaan memori dalam Mb (lalai 0.5)
-z
Tetapkan faktor zum (mampatan).
-p
Tetapkan faktor piksel secara manual (nisbah nilai piksel/skor)
-W
Tetapkan saiz tingkap gelongsor. (K => anggaran Karlin/Altschul)
-M
Baca dalam matriks skor daripada (Format letupan; Lalai: Blosum62).
-F
Baca dalam urutan dan data daripada (menggantikan sequencefiles).
-f
Baca segmen ciri daripada
-H Jangan mengira dotplot pada permulaan.
-R Alat Greyramp terbalik pada permulaan.
-r Membalikkan dan melengkapkan jujukan_mendatar (DNA lwn Protein)
-D Jangan paparkan imej cermin dalam perbandingan diri
-w Untuk DNA: untaian atas jujukan mendatar sahaja (Watson)
-c Untuk DNA: helai bawah jujukan mendatar sahaja (Crick)
-q
Mengimbangi jujukan_mendatar
-s
Offset jujukan_menegak
Beberapa pilihan X: -acefont Fon utama. -font Fon menu.
Gunakan dotter dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net