Ini ialah arahan e-PCR yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
e-PCR — Cari tapak bertanda jujukan (STS) dalam jujukan DNA
SINOPSIS
e-PCR [-hV] [pilihan posix] stsfile [fasta ...] [compat-options]
DESCRIPTION
Program ini menggantikan letupan di lokasi pasangan primer pada genom yang mungkin
menghasilkan produk PCR.
PILIHAN
pilihan posix ialah:
-m=## Margin (lalai 50)
-w=## Saiz perkataan (lalai 7)
-n=## Ketakpadanan maksimum dibenarkan (lalai 0)
-g=## Indel maksimum dibenarkan (lalai 0)
-f=## Gunakan ## perkataan yang tidak jelas, perlahan jika ##>1
-o=## Tetapkan fail output
-t=## Tetapkan format output:
1 - klasik, julat (pos1..pos2)
2 - klasik, titik tengah
3 - jadual
4 - jadual dengan penjajaran dalam ulasan (perlahan)
-d=##-## Tetapkan julat saiz lalai (lalai 100-350)
-p=+- Hidupkan/matikan hits selepas proses
-v=## Bendera verbosity
-a=a|f Gunakan penjajaran prasaiz (hanya jika jurang>0), perlahan
a - Sentiasa atau f - sebagai Fallback
-x=+- Gunakan pelekat huruf kecil hujung 5' untuk primer (lalai -)
-u=+- Huruf besar semua primer (lalai -)
compat-options (pendua posix-options) ialah
M=## Margin (lalai 50)
W=## Saiz perkataan (lalai 7)
N=## Bilangan ketidakpadanan yang dibenarkan (lalai 0)
G=## Indel maksimum dibenarkan (lalai 0)
F=## Gunakan ## perkataan terputus-putus
O=## Tetapkan fail output kepada ##
T=## Tetapkan format output (1..3)
D=##-## Tetapkan julat saiz lalai
P=+- Kesan selepas proses hidup/mati
V=## Bendera verbosity
A=a|f Gunakan penjajaran prasaiz (hanya jika jurang>0), perlahan
a - Sentiasa atau f - sebagai Fallback
X=+- Gunakan pelekat huruf kecil hujung 5' untuk primer (lalai -)
U=+- Huruf besar semua primer (lalai -)
-pertengahan Sama seperti T=2
Untuk maklumat tentang pilihan lanjut hubungi sahaja e-PCR tanpa sebarang pilihan.
Gunakan e-PCR dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net