Ini ialah arahan gmod_fasta2gff3.plp yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS
JADUAL:
NAMA
$O - Tukar FASTA kepada GFF3 mudah
SINOPSIS
% $O [pilihan]
TALIAN PERINTAH PILIHAN
Direktori --fasta_dir mengandungi fail fasta
(lalai: ./fasta)
--gfffilename Nama fail GFF3 yang akan dibuat
(lalai: ./out.gff)
--type SO type untuk diberikan kepada setiap ciri
(lalai: EST)
--source Teks untuk muncul dalam lajur sumber
(lalai: .)
--attributes Tag tambahan=pasangan nilai untuk dipaparkan dalam lajur 9
--nosequence Tekan bahagian ##FASTA (iaitu, jangan
cetak urutan DNA)
DESCRIPTION
Skrip ini hanya mengambil koleksi fail fasta dan menukarnya kepada GFF3 mudah
sesuai untuk dimuatkan ke dalam chado.
PENGARANG
Scott Cain[e-mel dilindungi]>
Hak Cipta (c) 2006
Perpustakaan ini adalah perisian percuma; anda boleh mengedarkannya semula dan/atau mengubah suainya di bawah yang sama
istilah sebagai Perl sendiri.
Gunakan gmod_fasta2gff3.plp dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
