Ini ialah arahan hmm-assembler.pl yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS
JADUAL:
NAMA
hmm-assembler.pl - modul SNAP hmm-assembler.pl
SINOPSIS
hmm-assembler.pl [-PILIHAN [-MORE_OPTIONS]] [--] [PROGRAM_ARG1 ...]
PILIHAN
. berikutan watak tunggal pilihan adalah diterima:
Dengan hujah: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
Boolean (tanpa hujah): -r -o -x -p -t -1
Pilihan boleh digabungkan bersama. -- menghentikan pemprosesan pilihan. Ruang tidak diperlukan
antara pilihan dan hujah mereka.
Pilihan:
-i [500]
-e [1000]
-A [0:30]
-D [0:9]
-M [0:15]
-S [0:9]
-C [4]
-I [4]
-N [4]
-3 [] sertakan model 3'UTR, memerlukan -a
-a [] sertakan model PolyA, memerlukan -3
-5 [] sertakan 5'UTR moel, memerlukan -p
-p termasuk model promoter generik, memerlukan -5
-r termasuk model ulangan generik
-o termasuk model ORF terbalik
-x gunakan model intron tempoh eksplisit
-t termasuk C.elegans trans-splicing, memerlukan -p, -5
-Z menetapkan nilai khusus clade (cacing, lalat, tumbuhan)
-1 model gen tunggal
-c
termasuk model penderma sambatan GC-AG
Gunakan hmm-assembler.pl dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net