Ini ialah arahan libscanoute yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
libscanout - Membaca fail DHF dan menulis fail Kelas skor tertinggi, Lipatan dan
Superfamili.
SINOPSIS
libscanout -dhfinfile dalam fail -fail luar fail luar
libscanout -membantu
DESCRIPTION
libscanout ialah program baris arahan daripada EMBOSS (“The European Molecular Biology Open
Suite Perisian”). Ia adalah sebahagian daripada kumpulan arahan "Protein:3D Structure".
PILIHAN
Input seksyen
-dhfinfile dalam fail
Pilihan ini menentukan lokasi fail DHF (fail hits domain) (input). A
'fail hits domain' mengandungi hits pangkalan data (urutan) dengan klasifikasi domain
maklumat, dalam format FASTA atau EMBL. Hit adalah saudara kepada keluarga SCOP atau CATH
dan ditemui daripada carian pangkalan data jujukan. Fail yang mengandungi hits diambil oleh
PSIBLAST dijana dengan menggunakan SEQSEARCH.
diperlukan seksyen
Output seksyen
-fail luar fail luar
Pilihan ini menentukan lokasi fail ringkasan (output). Fail ringkasan
mengandungi senarai Kelas domain, Superfamilies dan Families yang disusun berdasarkan kedudukannya
daripada markah (pemarkahan tertinggi dahulu).
Gunakan libscanoute dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
