Ini ialah perintah ltrsif yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
ltrsif - antara muka grafik untuk pasca pemprosesan dan klasifikasi LTR
calon retrotransposon
SINOPSIS
ltsifkan
DESCRIPTION
LTRsift ialah alat desktop grafik untuk pemprosesan pasca separa automatik bagi ramalan de novo
Anotasi retrotransposon LTR, seperti yang dijana oleh LTRharvest dan LTRdigest.
CONFIGURATION
Perduaan LAST (lastal dan lastdb) harus terletak dalam laluan carian sistem. Jika mereka
tidak, adakah mungkin untuk menentukan lokasi mereka menggunakan persekitaran "GT_LAST_PATH".
pembolehubah sebelum menjalankan LTRsift. Perkara yang sama berlaku untuk lokasi BLAST. guna
``GT_BLAST_PATH" untuk menentukan laluan penuh ke "blastall" boleh laku.
Fail gaya (menghuraikan bagaimana rupa rajah linear bagi ciri calon) boleh jadi
ditetapkan melalui pembolehubah persekitaran LTRSIFT_STYLE_FILE. Gaya lalai yang wajar dibina
ke dalam LTRsift.
Gunakan ltrsif dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net