Ini ialah command maskAlignedReads yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
maskAlignedReads.py - Bacaan sejajar topeng dalam fail wilayah
DESCRIPTION
penggunaan: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l FAIL LOG] [-d] [-i]
inCmpFile inRgnFofn outRgnFofn
Gunakan in.cmp.h5 untuk menutup kawasan sepadan fail dalam in.rgn.h5, tulis output kepada yang baharu
rgn.fofn.
kedudukannya hujah:
inCmpFile
Fail cmp.h5 input.
dalamRgnFofn
Sekumpulan fail jadual kawasan input.
outRgnFofn
Sekumpulan fail jadual rantau output.
pilihan hujah:
-h, - membantu
tunjukkan mesej bantuan ini dan keluar
-v, --versi
tunjukkan nombor versi program dan keluar
-l FAIL LOG, --fail log FAIL LOG
Tentukan fail untuk log masuk. Lalai kepada stderr. (lalai: Tiada)
-d, --nyahpepijat
Meningkatkan verbositi pengelogan (lalai: Palsu)
-i, --maklumat
Paparkan entri log bermaklumat (lalai: Palsu)
Gunakan maskAlignedReads dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net