EnglishFrenchSpanyol

Jalankan pelayan | Ubuntu > | Fedora > |


Favicon OnWorks

micro_razers - Dalam Talian di Awan

Jalankan micro_razers dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks melalui Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS

Ini ialah arahan micro_razers yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.

JADUAL:

NAMA


micro_razers

SINOPSIS

micro_razers [PILIHAN]

DESCRIPTION

MicroRazerS menggunakan strategi pemetaan berasaskan awalan untuk memetakan bacaan RNA kecil mungkin
mengandungi jujukan penyesuai 3'.

(c) Hak Cipta 2009 oleh Anne-Katrin Emde.

-h, - membantu

Memaparkan mesej bantuan ini.

--versi

Paparkan maklumat versi

Pilihan Utama::

-o, --pengeluaran FAIL

Tukar nama fail output. Lalai: .hasil.

-rr, --kadar-pengiktirafan NUM

tetapkan peratus kadar pengecaman Dalam julat [80..100]. Lalai: 100.

-sL, --panjang biji NUM

panjang biji Dalam julat [10..inf]. Lalai: 16.

-sE, --seed-error

membenarkan satu kesilapan dalam benih

-f, --ke hadapan

peta hanya dibaca ke hadapan helai.

-r, --terbalik

peta dibaca hanya untuk menterbalikkan helai.

-mN, --perlawanan-N

'N' sepadan dengan semua watak lain

-m, --max-hits NUM

keluarkan hanya NUM hits terbaik Dalam julat [1..inf]. Lalai: 100.

-pa, --purge-ambik

purge membaca dengan lebih daripada padanan terbaik max-hit

-lm, --ingatan yang lemah

mengurangkan penggunaan memori dengan mengorbankan masa jalan

-v, --verbose

mod verbose

-vv, --vverbose

mod yang sangat bertele-tele

Pilihan Format Output::

-daripada, --format-output NUM

Tetapkan format output. 0 = format MicroRazerS, 1 = SAM. Dalam julat [0..1].

-a, --penjajaran

buang penjajaran untuk setiap perlawanan

-gn, --penamaan genom NUM

Pilih cara genom dinamakan. 0 = gunakan Fasta id, 1 = enumerate bermula dengan 1. In
julat [0..1]. Lalai: 0.

-rn, --baca-penamaan NUM

Pilih cara bacaan dinamakan. 0 = gunakan Fasta id, 1 = enumerate bermula dengan 1. In
julat [0..1]. Lalai: 0.

-jadi, --aturan susunan NUM

Pilih cara padanan diisih. 0 = nombor baca, 1 = kedudukan genom. Dalam julat
[0..1]. Lalai: 0.

-pf, --format-kedudukan NUM

Pilih penomboran kedudukan mula/tamat (lihat bahagian Koordinat di bawah). 0 = ruang jurang,
1 = ruang kedudukan. Dalam julat [0..1]. Lalai: 0.

VERSION

versi micro_razers: 1.0.1 Kemas kini terakhir Jul 2009

Gunakan micro_razers dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net


Ad


Ad