Ini ialah arahan obspectrophore yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
obspektrofor — kalkulator SPECTROPHORE
SINOPSIS
obspektrofor [pilihan] -i input_file
obspektrofor [-u | -h]
DESCRIPTION
obspektrofor boleh digunakan untuk menjana Spektrofor, yang merupakan deskriptor satu dimensi
dihasilkan daripada medan sifat yang mengelilingi molekul. Teknologi ini membolehkan
penerangan tepat tentang molekul dari segi sifat permukaan atau medannya. Perbandingan
medan sifat molekul menyediakan kaedah penjajaran bebas struktur yang teguh
aktif daripada kelas kimia yang berbeza. Apabila digunakan pada molekul seperti ligan dan
dadah, Spektrofor boleh digunakan sebagai deskriptor molekul yang berkuasa dalam bidang
kemoinformatik, saringan maya dan pemodelan QSAR.
PILIHAN
-i fail
Menentukan fail input molekul dari mana Spektrofor akan dikira. The
jenis fail dikesan secara automatik daripada sambungan fail.
-n nilai
Menentukan jenis normalisasi yang perlu dilakukan. Nilai yang sah ialah
(tanpa petikan): Tidak (lalai), ZeroMean, UnitStd and ZeroMeanAndUnitStd.
-a nilai
Menentukan ketepatan yang diperlukan dinyatakan sebagai saiz langkah sudut. Hanya yang berikut
nilai diskret dibenarkan: 1 | 2 | 5 | 10 | 15 | 20 (lalai) | 30 | 36 | 45 | 60
-s nilai
Menentukan jenis sangkar yang harus digunakan dari segi kumpulan titik asas:
P1 atau P-1. Nilai yang sah ialah (tanpa petikan): Tidak (lalai), Unik, Cermin and Semua.
-r nilai
Menentukan resolusi yang diperlukan dinyatakan sebagai nombor positif sebenar. lalai
nilai adalah 3.0 Angstrom. Nilai negatif atau nilai yang sama dengan 0 menjana ralat
mesej.
-u Paparkan butiran pelaksanaan.
-h Paparkan mesej bantuan.
Gunakan obspectrophore dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
