Ini ialah perintah tqs yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
tqs - Potong Urutan Solexa-Illumina Kualiti
SINOPSIS
Pangkas kualiti urutan solexa-Illumina dibaca menggunakan ambang yang ditentukan pengguna.
PILIHAN
-h, --bantuan
tunjukkan mesej bantuan ini dan keluar
-f SEQFILE, --sequence file=SEQFILE
Fail jujukan Illumina - Format output daripada Penganalisis Genom 1G (_seq.txt):
7 1 255 669
AACCCCCACTCCTACAACGCCATCATTCCCCTCGAC
-q QUALFILE, --qual file=QUALFILE
Fail prb yang mengandungi semua keamatan Illumina, seperti yang dikeluarkan oleh 1G
Penganalisis Genom (_prb.txt)
-l MER, --length=MER
Panjang jujukan dibaca (iaitu Bilangan kitaran jujukan, lalai=36)
-t THRESHOLD, --threshold=THRESHOLD
Nilai ambang keamatan asas (-40 hingga 40, lalai=5)
-d DIFF, --difference=DIFF
Perbezaan keamatan asas antara keamatan teratas dan kedua terbaik (1 hingga 80,
lalai=5)
-c CONSEC, --consec=CONSEC
Bilangan minimum asas berturut-turut yang melepasi nilai ambang (lalai=20)
-v, --verbose
Berjalan dalam mod Verbose.
Gunakan tqs dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
