Ini ialah arahan xtractor yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
xtractore - ekstrak jujukan yang sepadan dengan ciri beranotasi daripada jujukan yang diberikan
fail
SINOPSIS
xtractor [pilihan] ciri.gff3 urutan.fasta
DESCRIPTION
Pilihan:
-d|--nyahpepijat
cetak keluaran penyahpepijatan
-h|--bantuan
cetak mesej bantuan ini dan keluar
-i|--idfile: FAIL
fail yang mengandungi senarai ID ciri (1 setiap baris tanpa ruang); jika disediakan,
hanya ciri dengan ID dalam fail ini akan diekstrak
-o|--outfile: FILE
fail yang akan ditulis urutan output; lalai ialah terminal (stdout)
-t|--jenis: STRING
jenis ciri untuk diekstrak; boleh digunakan beberapa kali untuk mengekstrak ciri berbilang
jenis
-v|--versi
cetak nombor versi dan keluar
-V|--verbose
mencetak amaran bertele-tele dan mesej ralat
-w|--lebar: INT
lebar setiap baris jujukan dalam output Fasta; lalai ialah 80; ditetapkan kepada 0 untuk tidak
pemformatan
Gunakan xtractor dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
