Ini ialah apl Linux bernama Altrans untuk dijalankan di Linux dalam talian yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai altrans.v1.1.02.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama Altrans ini untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
Altrans untuk dijalankan di Linux dalam talian
Ad
DESCRIPTION
Altrans ialah kaedah untuk pengiraan relatif peristiwa penyambungan. Ia memerlukan fail penjajaran BAM daripada eksperimen RNA-seq dan fail anotasi dalam format GTF yang memperincikan lokasi ekson dalam genom. Ia menggunakan bacaan akhir berpasangan di mana satu pasangan memetakan ke satu ekson dan pasangan yang lain ke ekson yang berbeza dan/atau bacaan split merentangi simpang ekson ekson untuk mengira "pautan" antara dua ekson. Apabila terdapat ekson yang bertindih, ini dikumpulkan ke dalam "kumpulan ekson" dan bahagian unik setiap ekson dalam kumpulan ekson dikenal pasti yang digunakan semasa memberikan bacaan kepada ekson. Kiraan pautan yang dipastikan daripada kawasan unik dinormalisasi dengan kebarangkalian memerhatikan pautan sedemikian memandangkan taburan saiz sisipan yang dirujuk sebagai liputan pautan. Akhir sekali, metrik kuantitatif yang dihasilkan ialah pecahan liputan satu pautan berbanding jumlah liputan semua pautan yang dibuat oleh ekson pertama.Penonton
Sains/Penyelidikan
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/altrans/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
