Ini ialah apl Linux bernama BarraCUDA Fast Short Read Aligner yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai barracuda_0.7.107h.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama BarraCUDA Fast Short Read Aligner ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
Penjajaran Bacaan Pendek Pantas BarraCUDA
DESCRIPTION
Barracuda ialah penjajar jujukan berkelajuan tinggi berdasarkan BWA Sanger dan menggunakan seni bina Nvidia CUDA terkini untuk mempercepatkan penjajaran bacaan jujukan yang dijana oleh penjujukan generasi seterusnya.
Ciri-ciri
- Memperbaiki masalah dengan menyusun perisian dalam Ubuntu 16.04
- Tweak: Had 8 teras SAMPE kini ditarik balik
- Perisian pemeta baca penjujukan indeks FM menggunakan pecutan NVIDIA CUDA
- Output dalam format SAM untuk analisis hiliran
- Memerlukan kad grafik NVIDIA dengan keupayaan pengiraan 3.5 ke atas dan sekurang-kurangnya 1GB VRAM
- Memerlukan NVIDIA CUDA SDK toolkit 6.x ke atas dan NVIDIA driver 340 ke atas
- BarraCUDA diterbitkan pada Nota Penyelidikan BMC 2012, 5:27, doi:10.1186/1756-0500-5-27
- URL kertas: http://www.biomedcentral.com/1756-0500/5/27
- Projek ini disokong oleh pusat kecemerlangan CUDA di Universiti Cambridge
Penonton
Sains/Penyelidikan
Antaramuka pengguna
Barisan arahan
Bahasa Pengaturcaraan
C++, C
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/seqbarracuda/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.