Ini ialah apl Linux bernama ChIP-RNA-seqPRO untuk dijalankan dalam Linux dalam talian yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai cloudclientID.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama ChIP-RNA-seqPRO ini untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
ChIP-RNA-seqPRO untuk dijalankan di Linux dalam talian
DESCRIPTION
ChIP-RNA-seqPRO: Strategi untuk mengenal pasti kawasan penyahkawalseliaan epigenetik yang dikaitkan dengan penyambungan transkrip menyimpang dan tapak penyuntingan RNA. Skrip python boleh dijalankan dibungkus bersama-sama dengan perpustakaan anotasi tersuai, input data demo dan panduan README.9/26 : v1.1 Dikemas kini MAIN_IV untuk menyahpepijat ralat yang dilemparkan oleh panda python tidak lagi menyokong 'subset'.
Kod ini tidak lagi akan diselenggara/dikemas kini secara aktif di sini. Sumber berasaskan awan untuk analisis perbandingan set data epigenetik, variasi jujukan dan ekspresi kini tersedia. Sila lawati projek Cloudomics untuk sumber berasaskan awan: https://sourceforge.net/projects/cloudomics-for-aws/
Ciri-ciri
- Alat untuk analisis perbandingan pelbagai jenis epigenomik (ChIPseq, MBDseq, dll.) dan penjujukan berasaskan RNA set data sampel berpasangan
- Jika anda menggunakan alat ini atau mana-mana perpustakaan anotasi sila sertakan rujukan berikut: Juara M., Hlady R., Yan H., Evans J., Nie J., Lee J., Bogenberger J., Nandakumar K., Davila J., Moore R., Nair A., O'Brien D., Zhu Y., Kortüm K., Ordog T., Zhang Z., Joseph R., Kocher J., Jonasch E., Robertson K., Tibes R. dan H. Ho T. (2015). Strategi Bioinformatik untuk Mengenalpasti Kawasan Penyahkawalseliaan Epigenetik Berkaitan dengan Penyambungan Transkrip Aberrant dan penyuntingan RNA. Dalam Prosiding Persidangan Antarabangsa mengenai Model, Kaedah dan Algoritma Bioinformatik, muka surat 163-170. DOI: 10.5220/0005248001630170
Penonton
Sains/Penyelidikan
Bahasa Pengaturcaraan
Unix Shell, Python
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/chiprnaseqpro/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
