Ini ialah apl Linux bernama ForceGen yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai ForceGenV0.4.jar. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian aplikasi bernama ForceGen ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
ForceGen
DESCRIPTION
Sila sebutkan:ForceGen: terbitan tetap ikatan kovalen atom untuk Gromacs. Nash A, Collier T, Birch HL, de Leeuw NH. Jurnal Permodelan Molekul (2018), (24)5. DOI: 10.1007/s00894-017-3530-6
Video arahan:
https://youtu.be/fQVXv8Ge_tg
Balang boleh laku Java ini memperoleh pemalar daya ikatan tertib kedua untuk regangan ikatan dan sudut ikatan daripada pengiraan Gaussian mekanikal kuantum. Pengiraan adalah serasi dengan keluarga medan daya Amber atau mana-mana medan daya yang diperoleh daripada tensor tertib kedua Hessian daripada serpihan molekul. Output telah dibuat serasi dengan format topologi Gromacs.
Contoh penggunaan termasuk terbitan pemalar daya ikatan dan nilai keseimbangan untuk:
-logam terikat dalam tapak aktif protein
-asid amino yang diubah suai
-molekul kecil/molekul ubat
Zip contoh fail boleh didapati dengan mengikuti pautan "Semak Imbas Semua Fail".
Ditulis oleh Dr Anthony Nash (Oxford)
Disokong oleh Dr Thomas Collier, Prof Helen Birch &
Ciri-ciri
- Daya regangan bon terbitan malar
- Terbitan malar daya sudut ikatan
- Keserasian dengan topologi Gromacs
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/forcegen/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
