Ini ialah apl Linux bernama Hadoop-BAM yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai hadoop-bam-7.1.0.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama Hadoop-BAM ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
Hadoop-BAM
Ad
DESCRIPTION
Hadoop-BAM ialah perpustakaan Java untuk manipulasi fail dalam format bioinformatik biasa menggunakan rangka kerja Hadoop MapReduce dengan Picard SAM JDK, dan alatan baris arahan yang serupa dengan SAMtools.
Format fail yang disokong pada masa ini ialah BAM, SAM, FASTQ, FASTA, QSEQ, BCF dan VCF.
Untuk penerangan peringkat tinggi yang lebih panjang tentang Hadoop-BAM, rujuk artikel "Hadoop-BAM: secara langsung memanipulasi data penjujukan generasi seterusnya dalam awan" dalam Bioinformatics Volume 28 Issue 6 ms. 876-877, tersedia dalam talian di: http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bts054
Ambil perhatian bahawa bahagian perpustakaan Hadoop-BAM adalah terutamanya untuk pembangun yang berpengalaman dalam menggunakan Hadoop. Alat baris arahan Hadoop-BAM harus difahami oleh semua pengguna, tetapi skopnya terhad.
Lihat projek SeqPig untuk antara muka peringkat lebih tinggi kepada format fail yang disokong oleh Hadoop-BAM: http://seqpig.sourceforge.net
Lihat Seal untuk alat penjajaran baca berasaskan Hadoop, Seal: http://biodoop-seal.sourceforge.net
Penonton
Pemaju
Bahasa Pengaturcaraan
Java
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/hadoop-bam/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
