Ini ialah apl Linux bernama HSRA yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai HSRA-v1.1.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama HSRA ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
HSRA
Ad
DESCRIPTION
HSRA ialah alat selari berasaskan MapReduce untuk memetakan bacaan daripada eksperimen penjujukan RNA (RNA-seq). Analisis RNA-seq biasanya bermula dengan memetakan bacaan kepada genom rujukan untuk menentukan lokasi dari mana bacaan itu berasal, yang merupakan langkah yang sangat memakan masa. Alat ini membolehkan penyelidik bioinformatik mengagihkan tugas pemetaan mereka dengan cekap ke atas nod kluster dengan menggabungkan penjajar bersambung berbilang benang pantas (HISAT2) dengan Apache Hadoop, yang merupakan rangka kerja pengkomputeran teragih untuk pemprosesan Data Besar berskala.
HSRA pada masa ini menyokong penjajaran baca hujung tunggal dan hujung berpasangan daripada set data FASTQ/FASTA. Selain itu, alat kami menggunakan perpustakaan Hadoop Sequence Parser (HSP) (pautan di atas) untuk membaca set data input yang disimpan pada Sistem Fail Teragih Hadoop (HDFS) dengan cekap, yang dapat memproses set data yang dimampatkan dengan codec Gzip dan BZip2.
Penonton
Teknologi Maklumat, Industri Penjagaan Kesihatan, Sains/Penyelidikan
Antaramuka pengguna
Konsol/Terminal, Baris Perintah
Bahasa Pengaturcaraan
Java
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/hsra/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
