Ini ialah apl Linux bernama locusvu untuk dijalankan di Linux dalam talian yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai LocusVu.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama locusvu ini untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
locusvu untuk dijalankan dalam Linux dalam talian
DESCRIPTION
LocusVu ialah alat perisian berasaskan Java novel yang menerima senarai lokus genom (kedudukan pada kromosom) sebagai input dan mengautomasikan pengambilan maklumat berkaitan (jalur sitogenetik, nama gen, data OMIM dll.) daripada pangkalan data awam seperti pelayar genom UCSC pangkalan data. Ia kemudian mendayakan berbilang aliran kerja pada hasil yang diperoleh semula, seperti membandingkan berbilang set data (genomik perbandingan), melihat gen jiran untuk lokus dari dalam alat itu sendiri, atau secara grafik mewakili keputusan ini dalam carta bar / pai. LocusVu mempunyai GUI ringkas yang mudah digunakan pada bahagian hadapan yang membolehkan interaksi pengguna intuitif dengan logik asas.Alat ini boleh diperluaskan dengan mudah untuk menambah sokongan untuk pangkalan data lain (cth. Ensembl) atau untuk mengambil maklumat
daripada jadual lain dalam pangkalan data. Oleh itu, LocusVu menyediakan rangka kerja asas yang boleh digunakan oleh pengguna dan pembangun sama-sama dalam memudahkan aliran kerja sedia ada dan mencipta yang lebih baharu untuk menyokong analisis data dalam genomik.
Ciri-ciri
- Mengautomasikan pengambilan data daripada pangkalan data (kini pangkalan data pelayar genom UCSC)
- Mendayakan aliran kerja pada hasil yang diperoleh seperti..
- ..membandingkan berbilang set data (genomik perbandingan)
- ..lihat gen jiran untuk lokus (dari dalam alat itu sendiri)
- ..mewakili hasil secara grafik (carta bar / pai)
- GUI yang mudah digunakan pada bahagian hadapan untuk penggunaan intuitif
- Log dengan Log4j untuk penyahpepijatan yang mudah
- Mudah dipanjangkan
Penonton
Sains/Penyelidikan, Pemaju
Antaramuka pengguna
Java Swing
Bahasa Pengaturcaraan
Java
Persekitaran Pangkalan Data
MySQL
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/locusvu/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
