Ini ialah apl Linux bernama MIPGen yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai mipgen_v15.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama MIPGen ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
MIPGen
DESCRIPTION
Penjana Potensi Interaksi Molekul
MIPGEN ialah program python yang akan mengira grid Potensi Interaksi Molekul
ke atas molekul tertentu, yang mungkin sama ada protein atau sebatian organik kecil (ubat).
Output akan menjadi satu siri grid dengan format DX (*.dx) yang pengguna akan dapat
untuk memvisualisasikan menggunakan sebarang program visualisasi Molekul seperti VMD, PyMol, Chimera...
Untuk mendapatkan maklumat lanjut tentang kebergantungan dan penggunaan, sila baca Dokumentasi.
Pengguna dialu-alukan untuk menyiarkan sebarang pepijat atau permintaan di bawah menu BUGS & REQUESTS. (akaun sourceforge diperlukan).
Ciri-ciri
- Penjanaan MIP automatik sepenuhnya diberikan fail PDB yang mudah.
- Kod sumber terbuka. Pengguna dialu-alukan untuk menyumbang memanjangkan probe atau menambah baik kod.
- Kira potensi interaksi molekul berasaskan grid ke atas peptida dan sistem makromolekul lain (mungkin masih perlahan untuk sistem besar)
- Kira MIP ke atas molekul kecil
- Kuar boleh disesuaikan. Sudah dilaksanakan: Hidrofobik, penderma H-Bond, penerima H-Bond dan probe elektrostatik.
- Penugasan automatik jenis atom kepada molekul kecil dan protein dengan berantara muka dengan Antechamber sumber terbuka dan tLeap daripada pakej AmbertTools (http://ambermd.org)
Penonton
Sains/Penyelidikan, Pengguna Akhir Termaju, Pembangun, Pengguna Akhir/Desktop
Antaramuka pengguna
Konsol/Terminal
Bahasa Pengaturcaraan
Python
Persekitaran Pangkalan Data
SQLite
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/mipgen/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.