Ini ialah apl Linux bernama nichenetr yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai v2.0.4.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama nichenetr ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
nichenetr
DESCRIPTION
nichenetr: pelaksanaan R kaedah NicheNet. Matlamat NicheNet adalah untuk mengkaji komunikasi antara sel dari perspektif pengiraan. NicheNet menggunakan data ekspresi gen manusia atau tetikus bagi sel yang berinteraksi sebagai input dan menggabungkannya dengan model terdahulu yang menyepadukan pengetahuan sedia ada pada laluan isyarat ligan ke sasaran. Ini membolehkan untuk meramalkan interaksi reseptor ligan yang mungkin mendorong perubahan ekspresi gen dalam sel yang diminati. Model maklumat terdahulu tentang pautan sasaran ligan yang berpotensi ini kemudiannya boleh digunakan untuk membuat kesimpulan hubungan sasaran ligan aktif antara sel yang berinteraksi. NicheNet mengutamakan ligan mengikut aktivitinya (iaitu, sejauh mana mereka meramalkan perubahan yang diperhatikan dalam ekspresi gen dalam sel penerima) dan mencari sasaran terjejas yang berpotensi tinggi untuk dikawal oleh ligan yang diutamakan ini.
Ciri-ciri
- NicheNet sangat berbeza daripada kebanyakan pendekatan pengiraan semasa untuk mengkaji komunikasi antara sel
- Menilai sejauh mana ligan yang dinyatakan oleh sel penghantar boleh meramalkan perubahan dalam ekspresi gen dalam sel penerima yang mengutamakan ligan berdasarkan kesannya terhadap ekspresi gen
- Menyimpulkan pautan sasaran ligan yang diduga aktif dalam sistem yang dikaji
- Sahkan model sasaran ligan sebelumnya
- Pembinaan model sasaran ligan terdahulu yang ditentukan pengguna
- Kami menyediakan arahan tentang cara membuat visualisasi intuitif bagi ramalan utama
Bahasa Pengaturcaraan
R
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/nichenetr.mirror/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
