Ini ialah apl Linux bernama piv_clustering yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai piv_clustering_1.3.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama piv_clustering ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
piv_clustering
DESCRIPTION
Program ini membolehkan untuk melakukan analisis kelompok struktur bagi trajektori atom yang diperolehi, contohnya, daripada simulasi dinamik molekul.
Berbeza dengan pendekatan lain, adalah mungkin untuk menganalisis juga proses dalam larutan, contohnya, tindak balas kimia dalam air cecair, kerana metrik jarak adalah berdasarkan Vektor Invarian Permutasi (PIV) yang simetri di bawah pertukaran atom atau molekul yang sama, termasuk pada tapak yang sama kedua-dua darjah kebebasan terlarut dan pelarut. Pendekatannya adalah umum dan takrifan PIV hanya memerlukan untuk menentukan julat jarak interatomik yang relevan untuk proses yang dikaji. Sebagai alternatif, koordinat topologi SPRINT juga boleh digunakan, yang amat sesuai untuk struktur nano.
Output adalah pembahagian trajektori kepada beberapa kelompok struktur (iaitu set bingkai), membolehkan analisis dan visualisasi yang lebih mudah.
Sila baca dan petik Gallet & Pietrucci, J. Chem. Fizik. 139, 074101 (2013)
Ciri-ciri
- Pengelompokan struktur bagi trajektori atomistik
- Invarian permutasi: hablur, pepejal amorf, cecair, struktur nano
- Semua sel simulasi disokong (dari ortorombik ke triclininc)
- Pelaksanaan MPI selari
Penonton
Sains/Penyelidikan
Bahasa Pengaturcaraan
Fortran
Kategori
Ini ialah aplikasi yang juga boleh diambil daripada https://sourceforge.net/projects/pivclustering/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
