Ini ialah apl Linux bernama Protospacer Workbench yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai Protospacer_Workbench.MacOSX.64bit.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama Protospacer Workbench dengan OnWorks ini secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
Meja Kerja Protospacer
DESCRIPTION
Protospacer Workbench membantu mereka bentuk, menganalisis dan berkongsi tapak sasaran CRISPR untuk mana-mana organisma atau set jujukan berformat FASTA.Reka bentuk panduan-RNA untuk sistem penyuntingan genom CRISPR/Cas secara intuitif mudah, tetapi sukar dari segi pengiraan. Kesukaran utama timbul daripada keperluan untuk mengenal pasti potensi di luar sasaran yang mungkin agak berbeza daripada sasaran yang dimaksudkan. Alat dalam talian semasa untuk reka bentuk RNA panduan menyediakan antara muka mesra pengguna untuk menyusun perisian pemetaan seperti Bowtie atau BLAST. Walau bagaimanapun, walaupun pantas, algoritma pemetaan ini tidak direka bentuk dengan toleransi yang tinggi terhadap ralat, ciri yang penting untuk menentukan potensi di luar sasaran. Apabila alat dalam talian gagal, alat luar talian berjaya. Walau bagaimanapun, alat luar talian memerlukan pengetahuan tentang baris arahan yang hanya dimiliki oleh segelintir orang yang menggunakan CRISPR. Protospacer Workbench bertujuan untuk merapatkan jurang antara reka bentuk RNA panduan dalam talian dan luar talian. Perisian ini kini tersedia untuk OS X dan akan dialihkan ke sistem pengendalian lain tidak lama lagi.
Ciri-ciri
- Cari semua sasaran CRISPR yang tersedia dengan cepat
- Menilai reka bentuk panduan-RNA dengan teliti
- Kongsi sasaran dan senarai panduan-RNA
- Reka bentuk untuk mana-mana organisma
- Uruskan berbilang pangkalan data
- Aliran kerja langkah demi langkah
- Dapatkan laporan tentang prestasi panduan-RNA yang dijangkakan
- Gunakan berbilang alatan pihak ketiga daripada satu antara muka
- Reka bentuk pelbagai sasaran
- Urus senarai sasaran/panduan-RNA yang besar
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/protospacerwb/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
