Ini ialah apl Linux bernama RNAseqR untuk dijalankan di Linux dalam talian yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai RNAseqR_1.1.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama RNAseqR ini untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
RNAseqR untuk dijalankan di Linux dalam talian
DESCRIPTION
RNAseqR direka bentuk untuk analisis ekspresi data RNA-seq, dan paling sesuai untuk analisis berbilang perpustakaan yang tidak direplikasi. Ia ialah program berkod C++ yang sedang disusun untuk sistem Linux.Dengan GUI dan antara muka baris arahan, ia boleh melakukan transformasi log, PPM dan/atau RPKM (jika panjang disediakan), serta, analisis statistik untuk ungkapan pembezaan, menggunakan fungsi taburan kumulatif binomial negatif (CDF) atau statistik ujian R diperkenalkan untuk analisis EST oleh Stekel, et al.
Output membolehkan keputusan berdasarkan kebarangkalian CDF, nilai R teratas atau perbandingan nilai R dengan data rawak. Perbandingan ialah metrik kebolehpercayaan Stekel et al, atau diperhatikan vs jangkaan R pada ungkapan min yang diberikan. Rawak adalah melalui Poisson atau taburan binomial negatif, atau shuffling lajur.
Bahasa Pengaturcaraan
C + +
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/rnaseqr/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
