Ini ialah apl Linux bernama UniPyRange untuk dijalankan dalam Linux dalam talian yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai UniPyRangeSuite.py. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama UniPyRange ini untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
UniPyRange untuk dijalankan di Linux dalam talian
DESCRIPTION
Skrip python yang sangat mudah yang menjimatkan kesakitan mengira asid amino/bes DNA dalam fail fasta daripada Pangkalan Data Uniprot dan NCBI RefSeq (1, 2).Katakan anda mahukan urutan asid amino dalam julat 128-387 daripada 1000 protein asid amino - skrip ini akan membantu anda mengelakkan kesilapan mengira dengan hanya menunjukkan kepada anda urutan yang ditentukan dalam asid amino dan pengekodan pasangan asas DNA (sesuai untuk reka bentuk primer amplifikasi ) daripada ID Uniprot yang ditentukan.
- Memerlukan BioPython (3) dan Pakej Bioservices (4)
(1)
Konsortium UniProt
UniProt: hab untuk maklumat protein
Asid Nukleik Res. 43: D204-D212 (2015).
(2)
RefSeq: kemas kini pada jujukan rujukan mamalia. Asid Nukleik Res. 2014 Jan 1;42(1):D756-63.
(3)
Ayam PJ et al. Bioinformatik (2009)
(4)
Cokelaer et al, Bioinformatik (2013)
Bahasa Pengaturcaraan
Python
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/unipyrange/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.