Dit is de opdracht aevol_misc_extract die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
aevol - een in silico experimenteel evolutieplatform
KORTE INHOUD
aevol_misc_extract -h | --help
aevol_misc_extract -V | --versie
aevol_misc_extract [-r ALGEMEEN | -p POP_FILE] [-t PHEN_FILE] [-s SEQ_BESTAND] [-g NUM_GU] [-b]
PRODUCTBESCHRIJVING
Aevol is een simulatieplatform waarmee men populaties van digitale organismen kan laten zien
evolueren in verschillende omstandigheden en experimenteel de mechanismen bestuderen die verantwoordelijk zijn voor de
structuur van het genoom en het transcriptoom.
aevol_misc_extract
extraheert het genotype en/of gegevens over het fenotype van individuen in de
verstrekte populatie en schrijf ze in tekstbestanden die gemakkelijk te parseren zijn met bijvoorbeeld matlab.
OPTIES
-H, --help
druk hulp af en sluit af
-V, --versie
print het versienummer en sluit af
-r ALGEMEEN
lees generatie GENER vanaf een volledige aevol-back-up
-p POP_FILE
lees de populatie die is opgeslagen in populatiebestand POP_FILE
-t PHEN_FILE
extraheer en bewaar enkele informatie over de fenotypes van de individuen die u wilt archiveren
PHEN_FILE
-s SEQ_BESTAND
extraheer de reeksen van de individuen en sla deze op in het bestand SEQ_FILE
-g aantal_gu
behandel alleen deze genetische eenheid (standaard: behandel alle genetische eenheden)
-b
behandel alleen het beste individu
Gebruik aevol_misc_extract online met behulp van onworks.net-services
