Dit is de opdracht arden-filter die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
arden-filter - filter een SAM-bestand op basis van de analyse met ARDEN
KORTE INHOUD
arden-filter [INVOER SAM] [UITVOERBESTAND] [OPTIES] ...
PRODUCTBESCHRIJVING
Script om te filteren en een SAM-bestand gebaseerd op de analyse met ARDEN. Het is nodig om
specificeer de gewenste grenswaarden voor RQS, GAPS en MM. Type: Pythonfilter -e 1 voor afdrukken
een paar voorbeelden.
OPTIES
Vereiste argumenten:
UITVOERBESTAND
Uitvoerbestandsnaam
INVOER Eén SAM-bestand om te filteren.
--versie
toon het versienummer van het programma en sluit af
-h, --help
toon dit helpbericht en sluit af
-r RQS, --rqs=RQS
Drempel voor minimale leeskwaliteitsscore.. [standaard: 0]
-m mm, --mismatches=MM
Drempel voor maximaal aantal mismatches in een alignement [standaard: 3]
-g GAPS, --hiaten=GAPS
Drempel voor het maximale aantal gaten in een uitlijning. [standaard: 3]
-e PVOORBEELDEN, --voorbeelden=PVOORBEELDEN
stel deze in op 1 als u voorbeelden wilt afdrukken
Gebruik arden-filter online met behulp van onworks.net-services
