Dit is de opdracht bp_seqcutp die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
bp_seqcut.pl
GEBRUIK
bp_seqcut.pl [opties -h,-s,-e,-f,-w] ...
bp_seqcut.pl [opties -h,-f,-w] se ...
-h dit helpbericht
-s op welk residu moet worden begonnen met snijden
-e op welk residu het snijden moet worden voltooid
-f-formaat van de bestanden, standaard ingesteld op FASTA, maar u kunt alles opgeven dat door SeqIO vanuit BioPerl wordt ondersteund
-w harde omloopbreedte, dit wordt mogelijk niet ondersteund, afhankelijk van het formaat dat u gebruikt
Omschrijving
Een script om FASTA-reeksen te knippen met een bepaald bereik `fastacut -s 1 -e 10 *.fasta` of
`fastacut 1-10 *.fasta`. Dit is slechts een gemaksverpakking rond de Bio::SeqIO-module.
Handig als u een gedeelte van een alignement wilt uitsnijden om een profiel van een specifiek alignement op te bouwen
gebied van sequentie.
Gebruik bp_seqcutp online met behulp van onworks.net-services