cmtk-dwi_mask_bad_slices - Online in de cloud

PROGRAMMA:

NAAM

dwi_mask_bad_slices - Vind slechte plakjes in een reeks diffusiegewogen afbeeldingen.

KORTE INHOUD

dwi_mask_bad_slices DiffusieImagePaths

PRODUCTBESCHRIJVING

Deze tool leest een reeks 3D-diffusie-gewogen MR-beelden en vindt slechte coupes. Een slecht stuk
in een diffusiebeeld wordt gedetecteerd als een beeld waarvan de gemiddelde intensiteit buiten een gespecificeerde
interval rond het gemiddelde van de gemiddelden van alle overeenkomstige plakjes van de resterende
diffusie beelden.

OPTIES

Globaal Toolkit Opties (deze zijn gedeeld by allen CMTK hulpmiddelen)
--help
Schrijf een lijst met basisopdrachtregelopties naar standaarduitvoer.

--Help iedereen
Schrijf een volledige lijst met basis- en geavanceerde opdrachtregelopties naar standaarduitvoer.

--wiki
Schrijf een lijst met opdrachtregelopties naar standaarduitvoer in MediaWiki-opmaak.

--Mens
Schrijf de man-paginabron in 'nroff'-opmaak naar standaarduitvoer.

--versie
Schrijf toolkitversie naar standaarduitvoer.

--echo
Schrijf de huidige opdrachtregel naar de standaarduitvoer.

--uitgebreid-niveau
Stel breedsprakigheidsniveau in.

--uitgebreid, -v
Verhoog het breedsprakigheidsniveau met 1 (verouderd; ondersteund voor achterwaartse compatibiliteit).

--draden
Stel het maximum aantal parallelle threads in (voor POSIX-threads en OpenMP).

Invoer Opties
--b0tel
Aantal b=0 afbeeldingen aan het begin van de afbeeldingenlijst. Deze zijn niet inbegrepen in
de slechte slice-detectie of maskering, maar worden ook naar de uitvoermap geschreven voor
gemak. Er wordt aangenomen dat alle b=0-afbeeldingen aan het begin van de lijst met staan
invoer afbeeldingen, maar niet aan het einde of in het midden. [Standaard: 0]

--slice-oriëntatie
Definieer de segmentoriëntatie van de diffusiebeelden. Ondersteunde waarden: "axiaal",
"sagittaal", "coronaal", "slice-x", "slice-y", "slice-z", waarbij de standaardwaarde "axiaal" is,
of gebruik een van de volgende:

--axiaal
Axiale plakjes [Dit is de standaard]

--sagittaal
Sagittale plakjes

--coronaal
Coronale plakjes

--plak-x
X-coördinaatas is plakrichting

--plak-y
Y-coördinaatas is plakrichting

--plak-z
Z-coördinaatas is plakrichting [Dit is de standaard]

slecht Plak Opsporing
--stdev
Drempel voor identificatie van slechte plakjes in eenheden van standaarddeviaties van intensiteit boven
alle bijbehorende plakjes van de resterende diffusiebeelden. [Standaard: 3]

uitgang Opties
--omzetten naar
Scalair gegevenstype voor de uitvoerafbeeldingen. Als uw opvulwaarde negatief is, maar uw
invoergegevens niet ondertekend, zorg er bijvoorbeeld voor dat u een ondertekend gegevenstype selecteert voor de
uitvoer. Het uitvoergegevenstype is standaard hetzelfde als het invoertype. Ondersteund
waarden: "char", "byte", "short", "ushort", "int", "uint", "float", "double", of gebruik
een van de volgende:

--char
8 bits, gesigneerd

--byte
8 bits, niet ondertekend

--kort
16 bits, gesigneerd

--ukort
16 bits, niet ondertekend

--in
32 bits ondertekend

--uint
32 bits niet ondertekend

--vlot
32 bits drijvende komma

--dubbele
64 bits drijvende komma

--opvulwaarde , -p
Opvulwaarde om gegevens van gedetecteerde slechte segmenten in uitvoerafbeeldingen te vervangen. [Standaard: -een]

--output-map , -o
Bestandssysteempad voor het schrijven van afbeeldingen met slechte segmenten gemaskeerd (dwz gevuld met a
opvulwaarde). [Standaard: GEEN]

AUTEURS

Torsten Rohlfing, met bijdragen van Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff en Yaroslav Halchenko

Gebruik cmtk-dwi_mask_bad_slices online met onworks.net-services