cmtk-registratie - Online in de Cloud

PROGRAMMA:

NAAM

registratie - Rigide en affiene registratie

KORTE INHOUD

registratie ReferentieAfbeelding ZwevendeAfbeelding

PRODUCTBESCHRIJVING

Dit programma voert een rigide en affiene beeldregistratie uit met behulp van meerdere resoluties
optimalisatie van voxel-gebaseerde beeldovereenkomstmetingen.

OPTIES

Globaal Toolkit Opties (deze zijn gedeeld by allen CMTK hulpmiddelen)
--help
Schrijf een lijst met basisopdrachtregelopties naar standaarduitvoer.

--Help iedereen
Schrijf een volledige lijst met basis- en geavanceerde opdrachtregelopties naar standaarduitvoer.

--wiki
Schrijf een lijst met opdrachtregelopties naar standaarduitvoer in MediaWiki-opmaak.

--Mens
Schrijf de man-paginabron in 'nroff'-opmaak naar standaarduitvoer.

--xml
Schrijf de syntaxisspecificatie van de opdrachtregel in XML-opmaak (voor Slicer-integratie).

--versie
Schrijf toolkitversie naar standaarduitvoer.

--echo
Schrijf de huidige opdrachtregel naar de standaarduitvoer.

--uitgebreid-niveau
Stel breedsprakigheidsniveau in.

--uitgebreid, -v
Verhoog het breedsprakigheidsniveau met 1 (verouderd; ondersteund voor achterwaartse compatibiliteit).

--draden
Stel het maximum aantal parallelle threads in (voor POSIX-threads en OpenMP).

Automatisering Opties
--auto-multi-niveaus
Automatische optimalisatie en resolutieparametergeneratie voor niveaus [Standaard:
0]

Optimization settings
--verkenning , -e
Verkenning [initiële optimalisatiestapgrootte] [Standaard: 8]

--nauwkeurigheid , -a
Nauwkeurigheid [stapgrootte uiteindelijke optimalisatie] [Standaard: 0.1]

--stapfactor , -f
Factor voor het verkleinen van de zoekstapgrootte. Moet > 0.0 en < 1.0 zijn [Standaard: 0.5]

--delta-f-drempel
Optionele drempel om optimalisatie (niveau) te beëindigen bij relatieve verandering van doel
functie zakt onder deze waarde. [Standaard: 0]

Beeld resolutie parameters
--bemonstering , -s
Beeldsampling (beste resampled beeldresolutie) [Standaard: 1]

--grofste
Bovengrens voor beeldbemonstering in hiërarchie met meerdere resoluties [Standaard: -een]

--laat-originele-gegevens weg
Gebruik geen originele gegevens in volledige resolutie, laat de laatste fase in multiresolutie weg
hiërarchie, waardoor de rekentijd wordt verkort.

Transformatie parameters
--dofs [, ,...]
Aantal vrijheidsgraden toevoegen [kan worden herhaald]

--dofs-finale [, ,...]
Voeg het aantal vrijheidsgraden alleen toe voor het laatste niveau [kan worden herhaald]

--geen-schakelaar, -n
Schakel referentie en zwevend beeld niet automatisch om voor betere berekeningen
prestatie

--initxlaat, -i
Geïnitialiseerde transformatie door het FOV-centrum van een zwevend beeld te vertalen naar referentie
beeld FOV-centrum

--voorletter
Initialiseer transformatie van gegeven pad [Standaard: GEEN]

--initiële-is-inverse
Inverteer de initiële transformatie voordat u de registratie initialiseert

Beeld gegevens
--registratie-metrisch
Registratiestatistiek voor bewegingsschatting door beeld-naar-beeldregistratie. Ondersteund
waarden: "nmi", "mi", "cr", "msd", "ncc", waarbij de standaardwaarde "nmi" is, of gebruik een van
het volgende:

--nmi
Genormaliseerde metrische gegevens over wederzijdse informatie [Dit is de standaard]

--mi Standaard metrische gegevens over wederzijdse informatie

--kr Correlatieverhouding metrisch

--msd
Mean kwadraat verschil metrische

--ncc
Genormaliseerde kruiscorrelatiestatistiek

--match-histogrammen
Match het zwevende beeldhistogram met het referentiebeeldhistogram.

Referentie Beeld Voorverwerking
--klasse-ref
Gegevensklasse: grijs (standaard) of label [Standaard: GEEN]

--pad-ref
opvulwaarde [Standaard: gehandicapt]

--dors-min-ref
Minimale waarde inkortingsdrempel [Standaard: gehandicapt]

--drempel-max-ref
Maximale waarde inkortingsdrempel [Standaard: gehandicapt]

--snoei-histogram-ref
Aantal vakken voor op histogram gebaseerde snoei [Standaard: gehandicapt]

--histogram-egalisatie-ref
Histogramvereffening toepassen

--sobel-filter-ref
Sobel-randdetectie-filter toepassen

--crop-index-ref
Bijsnijdgebied in pixelindexcoördinaten [geparseerd als %d,%d,%d,%d,%d,%d voor
i0,j0,k0,i1,j1,k1] [Standaard: GEEN]

--crop-wereld-ref
Bijsnijdgebied in wereldcoördinaten [geparseerd als %f,%f,%f,%f,%f,%f voor
x0,y0,z0,x1,y1,z1] [Standaard: GEEN]

Drijvend Beeld Voorverwerking
--klasse-vlt
Gegevensklasse: grijs (standaard) of label [Standaard: GEEN]

--pad-flt
opvulwaarde [Standaard: gehandicapt]

--dors-min-flt
Minimale waarde inkortingsdrempel [Standaard: gehandicapt]

--dors-max-flt
Maximale waarde inkortingsdrempel [Standaard: gehandicapt]

--snoei-histogram-flt
Aantal vakken voor op histogram gebaseerde snoei [Standaard: gehandicapt]

--histogram-egalisatie-flt
Histogramvereffening toepassen

--sobel-filter-flt
Sobel-randdetectie-filter toepassen

--crop-index-flt
Bijsnijdgebied in pixelindexcoördinaten [geparseerd als %d,%d,%d,%d,%d,%d voor
i0,j0,k0,i1,j1,k1] [Standaard: GEEN]

--crop-wereld-flt
Bijsnijdgebied in wereldcoördinaten [geparseerd als %f,%f,%f,%f,%f,%f voor
x0,y0,z0,x1,y1,z1] [Standaard: GEEN]

uitgang parameters
--outlijst , -o
Uitvoerpad voor definitieve transformatie [Standaard: GEEN]

--uit-matrix
Uitvoerpad voor uiteindelijke transformatie in matrixformaat [Standaard: GEEN]

--out-parameters
Uitvoerpad voor definitieve transformatie in gewone parameterlijstindeling [Standaard: GEEN]

--protocol , -p
Naam van het uitvoerbestand van het optimalisatieprotocol [Standaard: GEEN]

--tijd , -t
Naam van uitvoerbestand voor berekeningstijdstatistieken [Standaard: GEEN]

import Resultaten in Slicer
--uit-het
Uitvoerpad voor definitieve transformatie in ITK-formaat [Standaard: GEEN]

--schrijf-opnieuw geformatteerd
Schrijf opnieuw geformatteerde zwevende afbeelding. [Standaard: GEEN]

Afbeelding/transformatie Database
--db
Pad naar afbeelding/transformatiedatabase die moet worden bijgewerkt met de nieuwe
registratie en/of opnieuw geformatteerde afbeelding. [Standaard: GEEN]

AUTEURS

Torsten Rohlfing, met bijdragen van Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff en Yaroslav Halchenko

Gebruik cmtk-registratie online met behulp van onworks.net-services