Dit is de opdracht createChemistryHeader die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
createChemistryHeader.py - Maak een SAM-header met PacBio-sequencingchemie
informatie
PRODUCTBESCHRIJVING
gebruik: getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_bestanden BAS_FILES
[BAS_FILES ...]
invoer_uitlijningsbestand uitvoer_header_bestand
createChemistryHeader maakt een SAM-header die de chemie-informatie bevat die wordt gebruikt door
Pijlkoker.
positie- argumenten:
invoer_uitlijningsbestand
Een SAM- of BAM-bestand geproduceerd door BLASR.
uitvoer_header_bestand
Naam van het SAM- of BAM-headerbestand dat wordt gemaakt met chemie-informatie
geladen.
optioneel argumenten:
-h, --help
toon dit helpbericht en sluit af
--debuggen
Voer gedetailleerde logboekinformatie uit. (standaard: Onwaar)
--bas_bestanden BAS_FILES [BAS_FILES ...]
De bas- of bax-bestanden met de reads die zijn uitgelijnd in de
input_alignment_file. Kan ook een soort bas- of bax-bestanden zijn. (standaard: Geen)
Gebruik createChemistryHeader online met behulp van onworks.net-services
