Dit is de opdracht ecogrep die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online-emulator of MAC OS online-emulator
PROGRAMMA:
NAAM
ecogrep - ecoPCR-resultaat filteren op basis van taxonomisch id-filter en reguliere expressie
patroon
KORTE INHOUD
ecogrep [Opties] bestandsnaam
PRODUCTBESCHRIJVING
ecoPCR is een elektronische PCR-software ontwikkeld door LECA en Helix-Project. Het helpt om
schat de kwaliteit van streepjescodeprimers.
Dit programma behoort tot het exoPCR-pakket.
OPTIES
-1 : [EERST] : vergelijk het gegeven patroon met direct streng oligonucleotide
-2 : [TWEEDE] : vergelijk het gegeven patroon met omgekeerde streng oligonucleotide
-d : [D]atabase met taxonomische informatie
-e : [Fouten] : maximale fout toegestaan in patroonovereenkomst (optie-1, -2 en -p) (0 door
standaard)
-p : [P]attern : oligonucleotidepatroon
-h : [H]elp : afdrukken hulp
-i : [Ik] negeer substructuur onder gegeven taxonomische id
-r : [R]beperk zoekopdracht tot substructuur onder gegeven taxomische id
-v : in[V]ert het gevoel van overeenkomen, om niet-overeenkomende lijnen te selecteren.
argument:
naam van het ecoPCR-uitvoerbestand
Gebruik ecogrep online met behulp van onworks.net-services