het EngelsFransSpaans

Servers draaien | Ubuntu > | Fedora > |


OnWorks-favicon

edialigne - Online in de cloud

Voer edialigne uit in OnWorks gratis hostingprovider via Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator

Dit is de opdracht edialigne die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator

PROGRAMMA:

NAAM


edialign - Lokale meervoudige uitlijning van sequenties

KORTE INHOUD


edialign -sequenties seqset -nucmode lijst -revcomp boolean [-overlapw selectie]
[-koppeling lijst] [-maxfragl geheel getal] -fragmat boolean -fragsim geheel getal
[-itscore boolean] [-drempelwaarde drijven] -masker boolean -dostars boolean
-sternum geheel getal -outfile outfile -outseq vervolg

edialign -Help

PRODUCTBESCHRIJVING


edialign is een commandoregelprogramma van EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
softwarepakket"). Het maakt deel uit van de opdrachtgroep "Alignment:Multiple".

OPTIES


Invoer sectie
-sequenties seqset

Extra sectie
-nucmode lijst
Nucleïnezuursequentie-uitlijningsmodus (eenvoudig, vertaald of gemengd) Standaardwaarde: n

-revcomp boolean
Standaardwaarde: N

-overlapw selectie
Standaard worden overlapgewichten gebruikt wanneer Nseq =<35 maar u kunt dit instellen op 'ja' of
'nee' Standaardwaarde: standaard (wanneer Nseq =< 35)

-koppeling lijst
Clustermethode om sequentieboom te construeren (UPGMA, minimale koppeling of maximum
koppeling) Standaardwaarde: UPGMA

-maxfragl geheel getal
Standaardwaarde: 40

-fragmat boolean
Standaardwaarde: N

-fragsim geheel getal
Standaardwaarde: 4

-itscore boolean
Standaardwaarde: N

-drempelwaarde drijven
Standaardwaarde: 0.0

uitgang sectie
-masker boolean
Standaardwaarde: N

-dostars boolean
Standaardwaarde: N

-sternum geheel getal
Standaardwaarde: 4

-outfile outfile

-outseq vervolg

Gebruik edialigne online met onworks.net-services


Ad


Ad