Dit is de opdracht fastq-clipper die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
fastq-clipper - ea-utils: verwijdert een of meer adapterreeksen uit het fastq-bestand
PRODUCTBESCHRIJVING
gebruik: fastq-clipper [opties]
Verwijdert een of meer adapterreeksen uit het fastq-bestand. Adaptersequenties zijn
door dubbele punten gescheiden. Statistieken gaan naar stderr, tenzij -o is gespecificeerd.
OPTIES
-h Deze hulp
-o FIL Uitvoerbestand (statistieken naar stdout)
-p N Maximaal verschilpercentage (10)
-m N Minimale cliplengte (1)
-l N Minimale resterende reekslengte (15)
-x [N] Extra matchlengte voorbij adapterlengte,
N =-1: zoek alles N = 0: zoek alleen tot adapterlengte
-e Einde regel (standaard)
-b Begin van de regel (nog niet ondersteund)
Gebruik fastq-clipper online met behulp van onworks.net-services
