Dit is de opdracht fdnamle die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
fdnaml - Schat nucleotidefylogenie op basis van maximale waarschijnlijkheid
KORTE INHOUD
fdnaml -volgorde volg alles -intreebestand boom [-ncategorieën geheel getal] -tarief reeks
-categorieën vastgoed [-gewichten vastgoed] -lengtes boolean [-tratie drijven]
[-frequentiesvan toggle] -basisfreq reeks [-gamma lijst] -gammacoëfficiënt drijven
-ngammakat geheel getal -invarcoëfficiënt drijven -ninvarkat geheel getal -invarfrac drijven
-nhmmcategorieën geheel getal -hmmtarieven reeks -hmm waarschijnlijkheden reeks -adjsite boolean
-lambda drijven -nrommel geheel getal -zaad geheel getal -globaal boolean [-uitgr geheel getal]
[-ruw boolean] -uitbestand uitbestand [-forel toggle] -outtreebestand uitbestand
[-afdrukgegevens boolean] [-voortgang boolean] [-boomafdruk boolean] [-hypstaat boolean]
fdnaml -Help
PRODUCTBESCHRIJVING
fdnaml is een commandoregelprogramma van EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
softwarepakket"). Het maakt deel uit van de opdrachtgroep "Fylogenie:Moleculaire sequentie".
OPTIES
Invoer sectie
-volgorde volg alles
Bestand met een of meer sequentie-uitlijningen
-intreebestand boom
-ncategorieën geheel getal
Standaardwaarde: 1
-tarief reeks
-categorieën vastgoed
-gewichten vastgoed
Gewichten bestand
Extra sectie
-lengtes boolean
Standaardwaarde: N
-tratie drijven
Standaardwaarde: 2.0
-frequentiesvan toggle
Standaardwaarde: Y
-basisfreq reeks
Standaardwaarde: 0.25 0.25 0.25 0.25
-gamma lijst
Standaardwaarde: Constant tarief
-gammacoëfficiënt drijven
Standaardwaarde: 1
-ngammakat geheel getal
Standaardwaarde: 1
-invarcoëfficiënt drijven
Standaardwaarde: 1
-ninvarkat geheel getal
Standaardwaarde: 1
-invarfrac drijven
Standaardwaarde: 0.0
-nhmmcategorieën geheel getal
Standaardwaarde: 1
-hmmtarieven reeks
Standaardwaarde: 1.0
-hmm waarschijnlijkheden reeks
Standaardwaarde: 1.0
-adjsite boolean
Standaardwaarde: N
-lambda drijven
Standaardwaarde: 1.0
-nrommel geheel getal
-zaad geheel getal
Standaardwaarde: 1
-globaal boolean
Standaardwaarde: N
-uitgr geheel getal
-ruw boolean
Standaardwaarde: Y
uitgang sectie
-uitbestand uitbestand
-forel toggle
Standaardwaarde: Y
-outtreebestand uitbestand
-afdrukgegevens boolean
Standaardwaarde: N
-voortgang boolean
Standaardwaarde: Y
-boomafdruk boolean
Standaardwaarde: Y
-hypstaat boolean
Standaardwaarde: N
Gebruik fdnamle online met behulp van onworks.net-services
