Dit is de opdrachtgeneparse die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
geneparse - sequentie file loader frontend
SYNAPSE
geneparse [opties...] [invoer] [input2 ...] #lees invoer en schrijf naar stdout
PRODUCTBESCHRIJVING
Leest een sequentiebestand en schrijft het ergens naartoe (standaard naar stdout).
Een specifiek bereik binnen een invoerbestand kan worden opgegeven met file[start,stop]. Het plein
haakjes kunnen worden verwisseld voor elk van {[()]}, (bijv. "genome.fa[3000,4000]" of
"genome.fa{3000~4000}"). Houd er rekening mee dat deze allemaal door uw shell kunnen worden geparseerd. Ook
elk niet-woordteken kan worden gebruikt om de cijfers van elkaar te scheiden.
OPTIES
--herhaalmasker|-r
gebruik zacht herhaalde gemaskeerde reeksen (dwz: vervang kleine letters door N's).
--boven|--ontmaskeren|-U
alle basen in hoofdletters.
--lengte|-l
druk gewoon de lengte af en sluit af
--schoon|-c
voeg geen nieuwe regel toe als u klaar bent
--versie|-V
drukt de programmaversie af
--help|-h
drukt een helpbericht af
--uitvoer|-o
stuur uitvoer naar een bestand (gebruik anders stdout). --uitvoer impliceert --clean.
--stil|-q
stop alle waarschuwingen
--uitgebreid|-v
print veel extra details
Gebruik geneparse online met behulp van onworks.net-services
