Dit is de opdracht glam2scan die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
glam2scan - vindt een GLAM2-motief in een database
KORTE INHOUD
glamour2scan [opties] alfabet mijn_motief.glam2 mijn_seqs.fa
Een ander alfabet dan p or n wordt geïnterpreteerd als de naam van een alfabetbestand.
PRODUCTBESCHRIJVING
glamour2scan vindt overeenkomsten, in een sequentiedatabase, met een motief dat is ontdekt door glamour2. Elk
match krijgt een score die aangeeft hoe goed het bij het motief past.
OPTIES (STANDAARD INSTELLINGEN)
-h
Toon alle opties en hun standaardinstellingen.
-o
Uitvoerbestand (stdout).
-n
Aantal te rapporteren uitlijningen (25).
-2
Onderzoek beide strengen - voorwaartse en achterwaartse complement.
-D
Pseudotelling verwijderen (0.1).
-E
Pseudotelling zonder verwijdering (2.0).
-I
Invoeging pseudocount (0.02).
-J
Pseudotelling zonder invoeging (1.0).
-d
Dirichlet mengsel bestand.
Gebruik glam2scan online met onworks.net-services