Dit is de opdracht gt-gff3validator die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
gt-gff3validator - Valideer bepaalde GFF3-bestanden strikt.
KORTE INHOUD
gt gff3validator [optie ...] [GFF3_bestand ...]
PRODUCTBESCHRIJVING
-typecontrole [snaar]
gebruik een ontologie gegeven in een OBO-bestand om ouder-kindrelaties te valideren. Als Nee
argument wordt gegeven, wordt het bestand sofa.obo uit de map gtdata/obo_files gebruikt. Als
een argument wordt gegeven, wordt het gebruikt als een OBO-bestandsnaam. In het geval dat zo'n bestand dat doet
bestaat niet .obo wordt toegevoegd aan het argument en laadt de resulterende bestandsnaam uit de
gtdata/obo_files directory wordt geprobeerd. (standaard: ongedefinieerd)
-xrfcontrole [snaar]
controleer Dbxref en Ontology_term attributen voor juiste syntaxis volgens a
afkortingsdefinitiebestand. Als er geen argument wordt opgegeven, wordt het bestand GO.xrf_abbs uit de
gtdata/xrf_abbr directory wordt gebruikt. Als een argument wordt gegeven, wordt het gebruikt als een specifiek argument
bestandsnaam voor een afkortingsbestand. In het geval dat een dergelijk bestand niet bestaat,
.xrf_afk wordt toegevoegd aan het argument en laadt de resulterende bestandsnaam uit de
gtdata/xrf_abbr directory wordt geprobeerd. (standaard: ongedefinieerd)
-Help
help weergeven en afsluiten
-versie
versie-informatie weergeven en afsluiten
RAPPORTAGE BUGS
Rapporteer bugs aan[e-mail beveiligd]>.
Gebruik gt-gff3validator online met behulp van onworks.net-services
