Dit is het commando hmm-assembler.pl dat kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
hmm-assembler.pl - SNAP-module hmm-assembler.pl
KORTE INHOUD
hmm-monteur.pl [-OPTIES [-MEER OPTIES,--] [PROGRAMMA_ARG1
OPTIES
De volgend enkel karakter opties zijn geaccepteerd:
Met argumenten: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
Booleaanse waarde (zonder argumenten): -r -o -x -p -t -1
Opties kunnen worden samengevoegd. -- stopt de verwerking van opties. Er is geen ruimte nodig
tussen opties en hun argumenten.
Opties:
-i [500]
-e [1000]
-A [0:30]
-D [0:9]
-M [0:15]
-S [0:9]
-C [4]
-I [4]
-N [4]
-3 [] inclusief 3'UTR-model, vereist -a
-a [] inclusief PolyA-model, vereist -3
-5 [] omvat 5'UTR moel, vereist -p
-p omvatten een generiek promotormodel, vereist -5
-r inclusief een generiek herhalingsmodel
-o omvatten het omgekeerde ORF-model
-x gebruik het expliciete duur-intronmodel
-t omvat C.elegans trans-splicing, vereist -p, -5
-Z stelt clade-specifieke waarden in (worm, vlieg, plant)
-1 enkel genmodel
-c
inclusief het GC-AG-splitsingsdonormodel
Gebruik hmm-assembler.pl online met behulp van onworks.net-services