EngelsFransSpaans

Ad


OnWorks-favicon

jackhmmer - Online in de cloud

Voer jackhmmer uit in de gratis hostingprovider van OnWorks via Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator

Dit is de opdracht jackhmmer die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator

PROGRAMMA:

NAAM


jackhmmer - zoek iteratief sequentie(s) tegen een eiwitdatabase

KORTE INHOUD


jackhmmer [Opties]

PRODUCTBESCHRIJVING


jackhmmer zoekt iteratief elke queryreeks in tegen het doel
reeks(en) in . De eerste iteratie is identiek aan a phmmer zoekopdracht. Voor de
volgende iteratie, een meervoudige uitlijning van de query samen met alle doelreeksen
voldoen aan inclusie drempels wordt gemonteerd, wordt uit deze uitlijning een profiel opgebouwd
(identiek aan gebruik hmm bouwen op de uitlijning), en profiel zoeken van de gebeurt
(identiek aan een hmmzoeken met het profiel).

De vraag kan '-' zijn (een streepje), in welk geval de zoekreeksen dat zijn
lees van a pijp in plaats van uit een bestand. De kan niet worden gelezen van a
stroom, omdat jackhmmer moet meerdere passages over de database doen.

Het uitvoerformaat is ontworpen om door mensen leesbaar te zijn, maar is vaak zo omvangrijk dat
lezen is onpraktisch, en het ontleden is lastig. De --tblout en --domtblout opties
bewaar uitvoer in eenvoudige tabelindelingen die beknopt en gemakkelijker te ontleden zijn. De -o optie
maakt het mogelijk om de hoofduitvoer om te leiden, inclusief het weggooien in /dev/null.

OPTIES


-h Helpen; print een korte herinnering aan het gebruik van de opdrachtregel en alle beschikbare opties.

-N Stel het maximale aantal iteraties in op . De standaardwaarde is 5. Als N=1, het resultaat
betekent een phmmer zoeken.

OPTIES CONTROLEREN OUTPUT


Standaard verschijnt uitvoer voor elke iteratie op stdout in een enigszins voor mensen leesbare,
enigszins ontleedbaar formaat. Met deze opties kunt u die uitvoer omleiden of opslaan
extra soorten uitvoer naar bestanden, inclusief checkpoint-bestanden voor elke iteratie.

-o Leid de voor mensen leesbare uitvoer naar een bestand .

-A Sla na de laatste iteratie een geannoteerde meervoudige uitlijning van alle treffers op
voldoen aan opnamedrempels (inclusief de oorspronkelijke zoekopdracht). in
Stockholm-formaat.

--tblout
Sla na de laatste iteratie een samenvatting in tabelvorm op van topreekshits in een
gemakkelijk ontleedbaar, kolomvormig, door witruimte gescheiden formaat.

--domtblout
Sla na de laatste iteratie een samenvatting in tabelvorm op van topdomeinhits in een
gemakkelijk ontleedbaar, kolomvormig, door witruimte gescheiden formaat.

--chkhm
Controleer aan het begin van elke iteratie de query HMM en sla deze op in een bestand met de naam
- .hmm WAAR is het iteratienummer (van 1..N).

--chkali
Controleer aan het einde van elke iteratie of alle domeinen naar wens zijn uitgelijnd
opnamedrempels (bijv. wat wordt de query HMM voor de volgende iteratie),
opslaan in een bestand met de naam <controlepunt filet voorvoegsel>- .sto in Stockholm-formaat,
WAAR is het iteratienummer (van 1..N).

--volgens Gebruik aanwinsten in plaats van namen in de hoofduitvoer, indien beschikbaar voor profielen
en/of reeksen.

--noali
Laat het uitlijningsgedeelte weg uit de hoofduitvoer. Dit kan de output sterk verminderen
volume.

--geentekstw
Unlimit de lengte van elke regel in de hoofduitvoer. De standaard is een limiet van 120
tekens per regel, wat helpt bij het netjes weergeven van de uitvoer op terminals en
in editors, maar kan de beschrijvingsregels van het doelprofiel afkappen.

--tekstw
Stel de lijnlengtelimiet van de hoofduitgang in op tekens per regel. De standaardwaarde is
120.

OPTIES CONTROLEREN ENKEL VOLGORDE SCOREN (EERST ITERATIE)


Standaard gebruikt de eerste iteratie een zoekmodel dat is opgebouwd uit een enkele query
reeks. Dit model is geconstrueerd met behulp van een standaard 20x20 substitutiematrix voor residu
waarschijnlijkheden, en twee aanvullende parameters voor positie-onafhankelijke gap open en gap
kansen uitbreiden. Met deze opties zijn de standaardscoreparameters voor één reeks mogelijk
te veranderen.

--openen
Stel de gap open-kans voor een querymodel met een enkele reeks in op . De standaard
is 0.02. moet >= 0 en < 0.5 zijn.

--verlengen
Stel de gap-extend-kans voor een querymodel met een enkele reeks in op . De
standaard is 0.4. moet >= 0 en < 1.0 zijn.

--mx
Verkrijg residu-uitlijningskansen uit de ingebouwde substitutiematrix genoemd
. Verschillende standaardmatrices zijn ingebouwd en hoeven niet te worden gelezen
bestanden. De matrixnaam kan PAM30, PAM70, PAM120, PAM240, BLOSUM45 zijn,
BLOSUM50, BLOSUM62, BLOSUM80 of BLOSUM90. Slechts een van de --mx en --mxbestand
opties kunnen worden gebruikt.

--mxbestand
Verkrijg residu-uitlijningskansen uit de substitutiematrix in het bestand
. De standaardscorematrix is ​​BLOSUM62 (deze matrix is ​​intern in HMMER
en hoeft niet als bestand beschikbaar te zijn). Het formaat van een substitutiematrix
is het standaardformaat dat wordt geaccepteerd door BLAST, FASTA en andere reeksen
analyse software.

OPTIES CONTROLEREN RAPPORTAGE DREMPELS


Rapporteringsdrempels bepalen welke treffers worden gerapporteerd in uitvoerbestanden (de hoofduitvoer,
--tblout en --domtblout). In elke iteratie worden reekshits en domeinhits gerangschikt
door statistische significantie (E-waarde) en output wordt gegenereerd in twee secties genaamd per-
doel- en domeinoutput. In uitvoer per doel worden standaard alle sequentiehits met een
E-waarde <= 10 worden gerapporteerd. In de output per domein, voor elk doelwit dat per-
target rapportagedrempels, alle domeinen die voldoen aan de rapportagedrempels per domein
gemeld. Standaard zijn dit domeinen met voorwaardelijke E-waarden van <= 10. Het volgende
Met opties kunt u de standaard rapportagedrempels voor de E-waarde wijzigen of bitscore gebruiken
drempels in plaats.

-E Rapporteer sequenties met E-waarden <= in uitvoer per reeks. De standaardwaarde is 10.0.

-T Gebruik een bitscoredrempel voor uitvoer per reeks in plaats van een E-waardedrempel
(elke instelling van -E wordt genegeerd). Rapporteer sequenties met een bitscore van >= . Door
standaard is deze optie uitgeschakeld.

-Z Declareer de totale grootte van de database reeksen, ten behoeve van de E-waarde
berekening. Normaal gesproken worden E-waarden berekend in verhouding tot de grootte van de database
u daadwerkelijk heeft gezocht (bijv. het aantal sequenties in doel_seqdb). In bepaalde
cases (bijvoorbeeld als u uw doelreeksdatabase heeft opgesplitst in meerdere
bestanden voor parallellisatie van uw zoekopdracht), weet u misschien beter wat de werkelijke grootte is
van uw zoekruimte is.

--koepel
Rapporteer domeinen met voorwaardelijke E-waarden <= bovendien in uitvoer per domein
naar het best scorende domein per significante sequentiehit. De standaardwaarde is 10.0.

--domT
Gebruik een bitscoredrempel voor uitvoer per domein in plaats van een E-waardedrempel
(elke instelling van --domT wordt genegeerd). Rapporteer domeinen met een bitscore van >= in
output per domein, naast het best scorende domein per significante reeks
hit. Deze optie is standaard uitgeschakeld.

--domZ
Verklaar het aantal significante reeksen dat moet zijn reeksen, met het oog op
voorwaardelijke E-waardeberekening voor extra domeinbetekenis. Normaal gesproken
voorwaardelijke E-waarden worden berekend in verhouding tot het aantal doorgegeven reeksen
rapportagedrempel per reeks.

OPTIES CONTROLEREN INCLUSIE DREMPELS


Opnamedrempels bepalen welke treffers worden opgenomen in de meervoudige uitlijning en het profiel
gemaakt voor de volgende zoekiteratie. Een sequentie moet standaard een per-
reeks E-waarde van <= 0.001 (zie -E optie) op te nemen, en eventuele aanvullende domeinen in
het moet naast de best scorende een voorwaardelijke E-waarde van <= 0.001 hebben (zie --koepel
keuze). Het verschil tussen rapportagedrempels en opnamedrempels is dat
opnamedrempels bepalen welke treffers daadwerkelijk worden gebruikt in de volgende iteratie (of de
uiteindelijke output meervoudige uitlijning als de -A optie wordt gebruikt), terwijl rapportagedrempels
controle over wat u in de uitvoer ziet. Meldingsdrempels zijn over het algemeen losser, dus dat kan
zie borderline-hits in de top van de ruis die van belang kunnen zijn.

--incl
Neem reeksen op met E-waarden <= in daaropvolgende iteratie of definitieve uitlijning
uitgevoerd door -A. De standaardwaarde is 0.001.

--incl
Gebruik een bitscoredrempel voor opname per reeks in plaats van een E-waarde
drempel (elke instelling van --incl wordt genegeerd). Voeg sequenties toe met een bitscore van
>= . Deze optie is standaard uitgeschakeld.

--incdomE
Neem domeinen op met voorwaardelijke E-waarden <= in volgende iteratie of finale
uitlijning uitgevoerd door -A, naast het best scorende domein per significant
volgorde hit. De standaardwaarde is 0.001.

--incdomT
Gebruik een bitscoredrempel voor opname per domein in plaats van een E-waardedrempel
(elke instelling van --incl wordt genegeerd). Voeg domeinen toe met een bitscore van >= . Door
standaard is deze optie uitgeschakeld.

OPTIES CONTROLEREN VERSNELLING HEURISTIEKEN


HMMER3-zoekopdrachten worden versneld in een driestapsfilterpijplijn: het MSV-filter, het
Viterbi-filter en het Forward-filter. Het eerste filter is het snelst en het meest
bij benadering; de laatste is het volledige Forward scoring-algoritme, het langzaamst maar het meest nauwkeurig.
Er is ook een biasfilterstap tussen MSV en Viterbi. Doelen die alle stappen doorstaan
in de versnellingspijplijn worden vervolgens onderworpen aan postprocessing - domeinidentificatie
en scoren met behulp van het Forward/Backward-algoritme.

In wezen zijn de enige vrije parameters die de heuristische filters van HMMER besturen de P-
waardedrempels die de verwachte fractie van niet-homologe sequenties regelen die slagen
de filters. Als u de standaarddrempels hoger instelt, wordt een groter deel van overschreden
niet-homologe reeks, toenemende gevoeligheid ten koste van snelheid; omgekeerd,
het instellen van lagere P-waardedrempels zal een kleiner deel passeren, waardoor de gevoeligheid afneemt
en toenemende snelheid. Als u de P-waardedrempel van een filter instelt op 1.0, betekent dit dat deze zal slagen
alle reeksen en schakelt het filter effectief uit.

Als u filterdrempels wijzigt, worden alleen doelen verwijderd of opgenomen; veranderen
filterdrempels veranderen niets aan bitscores, E-waarden of uitlijningen, die dat allemaal zijn
uitsluitend bepaald in de nabewerking.

--max Maximale gevoeligheid. Schakel alle filters uit, inclusief het biasfilter, en laat vol draaien
Voorwaartse/achterwaartse nabewerking op elk doel. Dit verhoogt de gevoeligheid
enigszins, tegen hoge kosten in snelheid.

--F1
Eerste filterdrempel; stel de P-waardedrempel in voor de MSV-filterstap. De
standaard is 0.02, wat betekent dat ongeveer 2% van de hoogst scorende niet-homoloog is
doelen zullen naar verwachting het filter passeren.

--F2
Tweede filterdrempel; stel de P-waardedrempel in voor de Viterbi-filterstap.
De standaardwaarde is 0.001.

--F3
Derde filterdrempel; stel de P-waardedrempel in voor de Forward filterstap. De
standaard is 1e-5.

--nobias
Schakel het biasfilter uit. Dit verhoogt de gevoeligheid enigszins, maar kan op een
hoge snelheidskosten, vooral als de query een vertekende residusamenstelling heeft (zoals
een repetitieve sequentieregio, of als het een membraaneiwit is met grote regio's van
hydrofobiciteit). Zonder het biasfilter kunnen te veel sequenties het filter passeren
met bevooroordeelde query's, wat leidt tot langzamer dan verwachte prestaties als de
rekenintensieve Forward/Backward-algoritmen dragen een abnormaal zware taak
te laden.

OPTIES CONTROLEREN PROFIEL CONSTRUCTIE (LATER ITERATIES)


Deze opties bepalen hoe consensuskolommen worden gedefinieerd in meerdere uitlijningen wanneer
profielen bouwen. Standaard, jackhmmer bevat altijd uw oorspronkelijke zoekopdrachtvolgorde
het uitlijningsresultaat bij elke iteratie, en consensusposities worden door die query gedefinieerd
volgorde: dat wil zeggen, een standaard jackhmmer profiel is altijd even lang als uw origineel
vraag, bij elke iteratie.

--snel Definieer consensuskolommen als kolommen met een breuk >= symfrac van residuen als
tegen hiaten. (Zie hieronder voor de --symfrac optie.) Hoewel dit de standaard is
profielconstructie optie elders (in hmm bouwen, in het bijzonder), het kan hebben
ongewenste effecten binnen jackhmmer, omdat een profiel iteratief naar binnen kan lopen
sequentieruimte verwijderd van uw oorspronkelijke zoekopdracht, waardoor er weinig of geen consensuskolommen overblijven
overeenkomend met zijn residuen.

--hand Definieer consensuskolommen in het volgende profiel met behulp van verwijzingsaantekeningen naar de veelvoud
uitlijning. jackhmmer propageert referentieannotatie van het vorige profiel naar
de meervoudige uitlijning en dan naar het volgende profiel. Dit is de standaardinstelling.

--symfrac
Definieer de residufractiedrempel die nodig is om een ​​consensuskolom te definiëren wanneer
met de --snel keuze. De standaardwaarde is 0.5. De symboolfractie in elke kolom is
berekend na rekening te hebben gehouden met de relatieve reeksweging en de kloof te negeren
tekens die overeenkomen met uiteinden van reeksfragmenten (in tegenstelling tot interne
toevoegingen/verwijderingen). Als u dit instelt op 0.0, betekent dit dat elke uitlijningskolom dat zal doen
worden toegewezen als consensus, wat in sommige gevallen nuttig kan zijn. Zet hem op 1.0
betekent dat alleen kolommen met 0 hiaten (interne invoegingen/verwijderingen) zullen zijn
toegewezen als consensus.

--fragmentatie
We willen terminale hiaten alleen als deleties tellen als de uitgelijnde volgorde bekend is
om volledig te zijn, niet als het een fragment is (bijvoorbeeld omdat slechts een deel ervan
werd gesequenced). HMMER gebruikt een eenvoudige regel om fragmenten af ​​te leiden: if the sequence length
L is kleiner dan of gelijk aan een breuk maal de lengte van de uitlijning in kolommen,
dan wordt de reeks behandeld als een fragment. De standaardwaarde is 0.5. Instelling
--fragmentatie0 definieert geen (niet-lege) reeks als een fragment; misschien wil je dat wel
doe dit als je weet dat je een zorgvuldig samengestelde uitlijning van volledige lengte hebt
opeenvolgingen. Instelling --fragmentatie1 definieert alle sequenties als fragmenten; je zou kunnen
wil dit doen als je weet dat je uitlijning volledig uit fragmenten bestaat, zoals
als vertaalde korte lezingen in metagenomische shotgun-gegevens.

OPTIES CONTROLEREN FAMILIELID GEWICHTEN


Telkens wanneer een profiel wordt opgebouwd uit een meervoudige uitlijning, gebruikt HMMER een ad-hocvolgorde
wegingsalgoritme om nauw verwante sequenties te downweighten en verre verwanten te upweighten
degenen. Dit heeft tot gevolg dat modellen minder bevooroordeeld worden door ongelijke fylogenetische
vertegenwoordiging. Twee identieke reeksen zouden bijvoorbeeld typisch elk de helft ontvangen
gewicht dat één reeks zou hebben (en dit is waarom jackhmmer maakt zich niet altijd druk om
inclusief uw originele queryreeks in de uitlijning van elke iteratie, zelfs als deze wordt gevonden
opnieuw in de database die u zoekt). Deze opties bepalen welk algoritme wordt gebruikt.

--wpb Gebruik het Henikoff positiegebaseerde sequentiewegingsschema [Henikoff en Henikoff,
J Mol. Biol. 243:574, 1994]. Dit is de standaardinstelling.

--wgsc Gebruik het Gerstein/Sonnhammer/Chothia-wegingsalgoritme [Gerstein et al, J. Mol.
Biol. 235:1067, 1994].

--wblosum
Gebruik hetzelfde clusterschema dat werd gebruikt om gegevens te wegen bij het berekenen van BLOSUM
vervangingsmatrices [Henikoff en Henikoff, Proc. Natl. Acad. Sc. 89:10915, 1992].
Sequenties zijn geclusterd met een enkele koppeling bij een identiteitsdrempel (standaard 0.62; zie
--breed) en binnen elk cluster van c-reeksen krijgt elke reeks een relatief gewicht
1/c.

--geen
Geen relatieve gewichten. Aan alle reeksen wordt een uniform gewicht toegekend.

--breed
Stelt de identiteitsdrempel in die wordt gebruikt door single-linkage clustering bij gebruik --wblosum.
Ongeldig met elk ander wegingsschema. Standaard is 0.62.

OPTIES CONTROLEREN EFFECTIEF VOLGORDE NUMMER


Nadat relatieve gewichten zijn bepaald, worden ze genormaliseerd om op te tellen tot een totaal effectief
volgnummer, eff_nseq. Dit aantal kan het daadwerkelijke aantal sequenties in de
uitlijning, maar het is bijna altijd kleiner dan dat. De standaard entropieweging
methode (--ent) vermindert het effectieve volgnummer om de informatie-inhoud te verminderen
(relatieve entropie, of gemiddelde verwachte score op echte homologen) per consensuspositie. De
doel relatieve entropie wordt bestuurd door een functie met twee parameters, waarbij de twee
parameters zijn instelbaar met --er en --esigma.

--eens Pas het effectieve volgnummer aan om een ​​specifieke relatieve entropie per te bereiken
positie (zie --er). Dit is de standaardinstelling.

--eclus
Stel het effectieve volgnummer in op het aantal enkelvoudige koppelingsclusters bij a
specifieke identiteitsdrempel (zie --eid). Deze optie wordt niet aanbevolen; het is voor
experimenten evalueren hoeveel beter --eens hij precies is.

--een
Schakel effectieve volgnummerbepaling uit en gebruik gewoon het daadwerkelijke aantal
opeenvolgingen. Een reden waarom u dit zou willen doen, is om te proberen het relatieve te maximaliseren
entropie/positie van uw model, wat handig kan zijn voor korte modellen.

--set
Stel expliciet het effectieve volgnummer voor alle modellen in op .

--er
Stel het minimale relatieve entropie-/positiedoel in op . Vereist --eens. Standaard
hangt af van het sequentiealfabet; voor eiwitsequenties is dit 0.59 bits/positie.

--esigma
Stelt de minimale relatieve entropie in die wordt bijgedragen door een volledige modeluitlijning, over
zijn hele lengte. Dit heeft tot gevolg dat korte modellen een hogere relatieve waarde hebben
entropie per positie dan --er alleen zou geven. De standaardwaarde is 45.0 bits.

--eid
Stelt de fractionele paarsgewijze identiteitsafsnijding in die wordt gebruikt door enkelvoudige koppelingsclustering met
de --eclus optie. De standaardwaarde is 0.62.

OPTIES CONTROLEREN PRIOREN


Bij profielconstructie worden gewogen tellingen standaard geconverteerd naar posterior
waarschijnlijkheidsparameterschattingen met behulp van gemengde Dirichlet-prioriteiten. Standaard mengsel Dirichlet
voorafgaande parameters voor eiwitmodellen en voor nucleïnezuur (RNA en DNA) modellen worden gebouwd
in. Met de volgende opties kunt u de standaard priors overschrijven.

--pnone Gebruik geen priors. Waarschijnlijkheidsparameters zijn gewoon de waargenomen parameters
frequenties, na relatieve sequentieweging.

--plaats Gebruik een Laplace +1 prior in plaats van de standaard mix Dirichlet prior.

OPTIES CONTROLEREN E-WAARDE KALIBRATIE


Schatting van de locatieparameters voor de verwachte scoreverdelingen voor MSV-filter
scores, Viterbi-filterscores en Forward-scores vereisen drie korte willekeurige reeksen
simulaties.

--Eml
Stelt de reekslengte in simulatie in die de locatieparameter mu schat
MSV filter E-waarden. Standaard is 200.

--EmN
Stelt het aantal sequenties in simulatie in dat de locatieparameter mu schat
voor MSV filter E-waarden. Standaard is 200.

--EvL
Stelt de reekslengte in simulatie in die de locatieparameter mu schat
Viterbi filter E-waarden. Standaard is 200.

--EvN
Stelt het aantal sequenties in simulatie in dat de locatieparameter mu schat
voor Viterbi filter E-waarden. Standaard is 200.

--EfL
Stelt de reekslengte in simulatie in die de locatieparameter tau schat
voor Forward E-waarden. Standaard is 100.

--EfN
Stelt het aantal reeksen in simulatie in dat de locatieparameter schat
tau voor Forward E-waarden. Standaard is 200.

--Eft
Stelt de massafractie van de staart in zodat deze past in de simulatie die de locatie schat
parameter tau voor Forward evalues. Standaard is 0.04.

ANDERE OPTIES


--nul2
Schakel de nul2-scorecorrecties uit voor eenzijdige compositie.

-Z Stel dat het totale aantal doelen in uw zoekopdrachten is , voor de doeleinden
van per-reeks E-waardeberekeningen, in plaats van het daadwerkelijke aantal doelen
gezien.

--domZ
Stel dat het totale aantal doelen in uw zoekopdrachten is , voor de doeleinden
van voorwaardelijke E-waardeberekeningen per domein, in plaats van het aantal doelen
die de meldingsdrempels hebben overschreden.

--zaad
Zaai de generator voor willekeurige getallen met , een geheel getal >= 0. Als is >0, elke
stochastische simulaties zullen reproduceerbaar zijn; hetzelfde commando zal hetzelfde geven
resultaten. Als 0 is, wordt de generator van willekeurige getallen willekeurig geplaatst, en
stochastische simulaties variëren van run tot run van hetzelfde commando. De standaard
zaad is 42.

--qformat
Verklaar dat de invoer query_seqbestand is in formaat . Geaccepteerd reeksbestand
formaten omvatten FASTA, EMBL, GenBank, DDBJ, UniProt, Stockholm en SELEX. Standaard
is om het formaat van het bestand automatisch te detecteren.

--tformat
Verklaar dat de invoer doel_seqdb is in formaat . Geaccepteerd reeksbestand
formaten omvatten FASTA, EMBL, GenBank, DDBJ, UniProt, Stockholm en SELEX. Standaard
is om het formaat van het bestand automatisch te detecteren.

--processor
Stel het aantal parallelle worker-threads in op . HMMER stelt dit standaard in op
het aantal CPU-kernen dat het in uw machine detecteert - dat wil zeggen, het probeert te maximaliseren
het gebruik van uw beschikbare processorkernen. Instelling hoger dan het aantal
beschikbare kernen is van weinig of geen waarde, maar misschien wilt u het ergens op instellen
minder. U kunt dit aantal ook regelen door een omgevingsvariabele in te stellen,
HMMER_NCPU.

Deze optie is alleen beschikbaar als HMMER is gecompileerd met ondersteuning voor POSIX-threads.
Dit is de standaardinstelling, maar het kan zijn uitgeschakeld tijdens het compileren van uw site
of machine om de een of andere reden.

--kraam
Voor het debuggen van de MPI master/worker-versie: pauzeer na het starten om de
ontwikkelaar om foutopsporingsprogramma's te koppelen aan de lopende master- en werkprocessen. Versturen
SIGCONT-signaal om de pauze op te heffen. (Onder gdb: (GDB) signaal VOLGENDE) (Alleen
beschikbaar als optionele MPI-ondersteuning was ingeschakeld tijdens het compileren.)

--mpi Uitvoeren in MPI master/worker-modus, met behulp van mpirun. (Alleen beschikbaar als optionele MPI
ondersteuning was ingeschakeld tijdens het compileren.)

Gebruik jackhmmer online met behulp van onworks.net-services


Gratis servers en werkstations

Windows- en Linux-apps downloaden

  • 1
    fre:ac - gratis audio-omzetter
    fre:ac - gratis audio-omzetter
    fre:ac is een gratis audio-omzetter en cd
    ripper voor verschillende formaten en encoders.
    Het beschikt over MP3, MP4/M4A, WMA, Ogg
    Vorbis-, FLAC-, AAC- en Bonk-indeling
    steun, ...
    Download fre:ac - gratis audio-omzetter
  • 2
    matplotlib
    matplotlib
    Matplotlib is een uitgebreide bibliotheek
    voor het maken van statische, geanimeerde en
    interactieve visualisaties in Python.
    Matplotlib maakt gemakkelijke dingen gemakkelijk en
    moeilijk ding...
    Matplotlib downloaden
  • 3
    Botman
    Botman
    Schrijf uw chatbot-logica een keer en
    sluit het aan op een van de beschikbare
    berichtenservices, waaronder Amazon
    Alexa, Facebook Messenger, Slack,
    Telegram of zelfs jij...
    Botman downloaden
  • 4
    Joplin
    Joplin
    Joplin is een gratis en open source
    notities maken en to-do applicatie dat
    kan een groot aantal noten verwerken
    Markdown-indeling, organiseer ze in
    notitieboekjes en...
    Joplin downloaden
  • 5
    gerbv - een Gerber (RS-274X) kijker
    gerbv - een Gerber (RS-274X) kijker
    Gerbv is een open source Gerber-bestand
    (alleen RS-274X) kijker. Gerbv laat je
    laad meerdere bestanden op elkaar,
    metingen doen op de weergegeven afbeelding,
    enzovoort. ...
    Download gerbv - een Gerber (RS-274X) viewer
  • 6
    Iometer
    Iometer
    Analysetool voor I/O-prestaties.
    Doelgroep: ontwikkelaars, informatie
    Technologie, Wetenschap/Onderzoek, Systeem
    Beheerders. Gebruikersinterface: Win32
    (MS-Windows). programma...
    Iometer downloaden
  • Meer "

Linux-commando's

Ad