Dit is de opdracht kmc_tools-kmers_subtract die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks met behulp van een van onze vele gratis online werkstations, zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
kmc_tools-kmers_subtract - bereken de aftrekking van twee KMC-databases
KORTE INHOUD
kmc_tools kmers_aftrekken <output
[uitvoer_params]>
PRODUCTBESCHRIJVING
De uitvoerdatabase bevat alleen k-mers die aanwezig zijn in de eerste invoerset, maar
afwezig in de tweede. De tellerwaarde is gelijk aan de waarde van de eerste ingang
in te stellen.
OPTIES
Voor elke ingang zijn er aanvullende parameters:
-ci
sluit k-meren uit die kleiner zijn dan keer
-cx
sluit k-meren uit die meer voorkomen dan keer
Voor uitvoer zijn er aanvullende parameters:
-ci
sluit k-meren uit die kleiner zijn dan keer
-cx
sluit k-meren uit die meer voorkomen dan keer
-cs
maximale waarde van een teller
VOORBEELD
kmc -k28 bestand1.fastq kmers1 tmp
kmc -k28 bestand2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools kmers_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_subtract -cs200
Gebruik kmc_tools-kmers_subtract online met behulp van onworks.net-services
