Dit is de opdracht maskAlignedReads die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
maskAlignedReads.py - Masker uitgelijnde leesbewerkingen in regio's-bestand
PRODUCTBESCHRIJVING
gebruik: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]
inCmpBestand inRgnFofn uitRgnFofn
Gebruik in.cmp.h5 om corresponderende regio's van bestanden in in.rgn.h5 te maskeren, schrijf uitvoer naar een nieuwe
rgn.fon.
positie- argumenten:
inCmpBestand
Een invoer cmp.h5-bestand.
inRgnFofn
Een aantal invoerregiotabelbestanden.
outRgnFofn
Een fofn van tabelbestanden met uitvoerregio's.
optioneel argumenten:
-h, --help
toon dit helpbericht en sluit af
-v, --versie
toon het versienummer van het programma en sluit af
-l LOGBESTAND, --logbestand LOGBESTAND
Geef een bestand op om in te loggen. Standaard ingesteld op stderr. (standaard: Geen)
-d, --debuggen
Verhoogt de uitgebreidheid van logging (standaard: False)
-i, --info
Informatieve logboekvermeldingen weergeven (standaard: False)
MaskAlignedReads online gebruiken met onworks.net-services