mia-2dseriessmoothgradMAD - Online in de cloud

PROGRAMMA:

NAAM

mia-2dseriessmoothgradMAD - Evalueer de pixelgewijze tijdsintensiteitsgradiënt van een 2D-afbeelding
series.

KORTE INHOUD

mia-2dseriegladgradMAD -i -o [Opties]

PRODUCTBESCHRIJVING

mia-2dseriegladgradMAD Gegeven een reeks afbeeldingen van temporele opvolging, evalueer de
temporele pixelgewijs gaussiaans en pixelgewijs zijn MAD evalueren. Een ruimtelijke voorfiltering kan
worden toegepast door extra plug-ins op te geven (filter/2dimage)

OPTIES

-i --in-file=(invoer, vereist); snaar
invoer segmentatie set

-o --out-file=(uitvoer, vereist); io
output bestandsnaam Voor ondersteunde bestandstypes zie PLUGINS:2dimage/io

-k --overslaan=0
Bestanden aan het begin overslaan Bestanden aan het begin overslaan

-e --enlarge-grens=5
Vergroot het bijsnijdvak met het aantal pixelsVergroot het bijsnijdvak met het aantal pixels

-c --bijsnijden
afbeelding bijsnijden voordat u statistieken uitvoert

-g --gauss=1
Gauss-filterbreedte voor verzachting van de gradiëntGauss-filterbreedte voor verzachting
het verloop

Help & Info
-V --verbose=waarschuwing
uitgebreide output, print berichten van een bepaald niveau en hogere prioriteiten.
Ondersteunde prioriteiten vanaf het laagste niveau zijn:
info ‐ Berichten op laag niveau
opsporen ‐ Functie-aanroep traceren
mislukken ‐ Rapporteer testfouten
waarschuwing ‐ Waarschuwingen
fout ‐ Meld fouten
debug ‐ Uitvoer debuggen
Bericht ‐ Normale berichten
fataal ‐ Rapporteer alleen fatale fouten

--auteursrechten
copyrightinformatie afdrukken

-h-help
print deze hulp

-? --gebruik
een korte help afdrukken

--versie
print het versienummer en sluit af

In behandeling
--draden=-1
Maximaal aantal te gebruiken threads voor verwerking. Dit aantal moet lager zijn
of gelijk aan het aantal logische processorcores in de machine. (-1:
automatische schatting). Maximaal aantal te gebruiken threads voor verwerking, This
getal moet lager zijn dan of gelijk zijn aan het aantal logische processorkernen in
de machine. (-1: automatische schatting).

PLUG-INS: 1d/ruimtekernel

cdiff Centrale differentiefilterkernel, spiegelrandvoorwaarden worden gebruikt.

(geen parameters)

gauss ruimtelijke Gauss-filterkernel, ondersteunde parameters zijn:

w = 1; uint in [0, inf)
halve filterbreedte.

PLUG-INS: 1d/splinekernel

bsplijn B-spline kernel creatie, ondersteunde parameters zijn:

d = 3; int in [0, 5]
Spline graad.

omoms OMoms-spline kernel creatie, ondersteunde parameters zijn:

d = 3; int in [3, 3]
Spline graad.

PLUG-INS: 2dbeeld/combiner

absdiff Beeldcombiner 'absdiff'

(geen parameters)

toevoegen Beeldcombiner 'toevoegen'

(geen parameters)

div Beeldcombiner 'div'

(geen parameters)

mul Beeldcombiner 'mul'

(geen parameters)

beneden Afbeeldingscombinatie 'sub'

(geen parameters)

PLUG-INS: 2D-afbeelding/filter

aangepast Adaptief mediaanfilter voor 2D-afbeeldingen, ondersteunde parameters zijn:

w = 2; int in [1, inf)
halve filterbreedte.

adgemeen Een adaptief gemiddelde filter dat werkt als een normaal gemiddeld filter, als de intensiteit
variatie binnen het filtermasker is kleiner dan de intensiteitsvariatie in het filtermasker
hele afbeelding, dat er een speciale formule wordt gebruikt als de lokale variatie groter is
dan de variatie van de beeldintensiteit. De ondersteunde parameters zijn:

w = 1; int in [1, inf)
halve filterbreedte.

aniso 2D Anisotroop beeldfilter, ondersteunde parameters zijn:

epsilon = 1; drijven in (0, inf)
iteratie wijzigingsdrempel.

iter = 100; int in [1, 10000]
aantal iteraties.

k = -1; zweven in [0, 100]
k de ruisdrempel (<=0 -> adaptief).

n = 8; set
buurt. Ondersteunde waarden zijn:( 4, 8, )

psi = plooi; dictaat
randstopfunctie. Ondersteunde waarden zijn:
raden - teststopfunctie
plooi - Tukey-stopfunctie
pm1 ‐ stopfunctie 1
pm2 ‐ stopfunctie 2

bandpas intensiteit bandpass filter, ondersteunde parameters zijn:

max = 3.40282e+38; vlot
maximum van de band.

Min = 0; vlot
minimaal van de band.

binariseren afbeelding binariseren filter, ondersteunde parameters zijn:

max = 3.40282e+38; vlot
maximaal geaccepteerd bereik.

Min = 0; vlot
minimaal geaccepteerd bereik.

dichtbij morfologisch sluiten, ondersteunde parameters zijn:

zinspelen = zwart; set
een hint naar de hoofdinhoud van de afbeelding. Ondersteunde waarden zijn:( zwart, wit,
)

vorm = [bol:r=2]; fabriek
structurerend element. Voor ondersteunde plug-ins zie PLUGINS:2dimage/shape

combiner Combineer twee afbeeldingen met de gegeven combiner-operator. als 'reverse' is ingesteld op
false, de eerste operator is de afbeelding die door de filterpijplijn is gegaan, en
de tweede afbeelding wordt geladen uit het bestand dat is opgegeven met de parameter 'afbeelding' de
moment dat het filter wordt uitgevoerd., ondersteunde parameters zijn:

beeld =(invoer, vereist, tekenreeks)
tweede afbeelding die nodig is in de combiner.

op =(vereist, fabriek)
Afbeeldingscombinatie die op de afbeeldingen moet worden toegepast. Zie voor ondersteunde plug-ins
PLUGINS: 2dimage/combiner

omkeren = 0; boel
keer de volgorde om waarin de afbeeldingen naar de combiner zijn gegaan.

converteren conversiefilter voor beeldpixelformaat, ondersteunde parameters zijn:

a = 1; vlot
lineaire conversieparameter a.

b = 0; vlot
lineaire conversieparameter b.

kaart = kiezen; dictaat
conversie mapping. Ondersteunde waarden zijn:
opteren ‐ een lineaire transformatie toepassen die het werkelijke invoerbereik toewijst aan
het volledige uitvoerbereik
reeks ‐ lineaire transformatie toepassen die het invoergegevenstype in kaart brengt
bereik naar het bereik van het uitvoergegevenstype:
kopiëren ‐ gegevens kopiëren bij het converteren
lineair ‐ lineaire transformatie toepassen x -> a*x+b
optstat ‐ een lineaire transformatie toepassen die wordt afgebeeld op basis van het invoergemiddelde en
variatie op het volledige uitvoerbereik

repn = ubyte; dictaat
pixeltype uitvoer. Ondersteunde waarden zijn:
geen ‐ geen pixeltype gedefinieerd
drijven ‐ drijvende komma 32 bits
sbyte ‐ ondertekend 8 bit
lang ‐ niet-ondertekende 64 bits
verdubbelen ‐ drijvende komma 64 bits
Sint ‐ ondertekend 32 bit
kortom ‐ niet-ondertekende 16 bits
kort ‐ ondertekend 16 bit
uint ‐ niet-ondertekende 32 bits
lang ‐ ondertekend 64 bit
beetje - binaire data
ubyte ‐ niet-ondertekende 8 bits

gewas Snijd een gebied van een afbeelding bij, het gebied wordt altijd vastgeklemd aan de originele afbeelding
size., ondersteunde parameters zijn:

einde = [[-1,-1]]; streambaar
einde van de oogstregio.

begin = [[0,0]]; streambaar
begin van het gewasgebied.

verwijden 2D-beeldstapelverwijdingsfilter, ondersteunde parameters zijn:

zinspelen = zwart; set
een hint naar de hoofdinhoud van de afbeelding. Ondersteunde waarden zijn:( zwart, wit,
)

vorm = [bol:r=2]; fabriek
structurerend element. Voor ondersteunde plug-ins zie PLUGINS:2dimage/shape

afstand 2D-beeldafstandsfilter, evalueert de afstandskaart voor een binair masker.

(geen parameters)

downscalen Verklein de invoerafbeelding door een bepaalde blokgrootte te gebruiken om de verkleining te definiëren
factor. Voorafgaand aan het schalen wordt de afbeelding gefilterd door een afvlakfilter om
elimineer hoogfrequente gegevens en vermijd aliasing-artefacten., ondersteund
parameters zijn:

b = [[1,1]]; 2dgrenzen
blokgrootte.

bx = 1; uint in [1, inf)
blokgrootte in x-richting.

by = 1; uint in [1, inf)
blokgrootte in y-richting.

pit = gauss; snaar
afvlakking van de filterkernel die moet worden toegepast, wordt de grootte van het filter geschat
op basis van de blokgrootte..

eroderen 2D-beeldstapelerodefilter, ondersteunde parameters zijn:

zinspelen = zwart; set
een hint naar de hoofdinhoud van de afbeelding. Ondersteunde waarden zijn:( zwart, wit,
)

vorm = [bol:r=2]; fabriek
structurerend element. Voor ondersteunde plug-ins zie PLUGINS:2dimage/shape

gauss isotroop 2D-gaussfilter, ondersteunde parameters zijn:

w = 1; int in [0, inf)
parameter voor filterbreedte.

graadnorm 2D-afbeelding naar gradiëntnormfilter, ondersteunde parameters zijn:

normaliseren = 0; boel
Normaliseer de gradiëntnormen naar bereik [0,1].

omkeren intensiteit omkeren filter

(geen parameters)

kbetekent 2D-beeld k-betekent filter. In het uitvoerbeeld vertegenwoordigt de pixelwaarde de
klaslidmaatschap en de klassencentra worden als attribuut in de afbeelding opgeslagen.,
ondersteunde parameters zijn:

c = 3; int in [2, inf)
aantal lessen.

label Label verbonden componenten in een binair 2D-beeld. Ondersteunde parameters zijn:

n = 4n; fabriek
Buurtmasker om connectiviteit te beschrijven. Zie voor ondersteunde plug-ins
PLUGINS:2dbeeld/vorm

labelkaart Afbeeldingsfilter om label-ID's opnieuw toe te wijzen. Alleen van toepassing op afbeeldingen met een integerwaarde
intensiteiten/labels., ondersteunde parameters zijn:

kaart =(invoer, vereist, tekenreeks)
Labeltoewijzingsbestand.

labelschaal
Een filter dat alleen uitvoervoxels maakt die al in de invoer zijn gemaakt
afbeelding. Schalen wordt gedaan met behulp van stemalgoritmen die het doel selecteren
pixelwaarde gebaseerd op het hoogste aantal pixels van een bepaald label in de
overeenkomstige brongebied. Als de regio bestaat uit twee labels met dezelfde
tellen, degene met het laagste aantal wint., ondersteunde parameters zijn:

buitenmaats =(vereist, 2dbounds)
doelgrootte gegeven als twee door coma gescheiden waarden.

laden Laad de invoerafbeelding uit een bestand en gebruik deze om de huidige afbeelding in de
pijplijn., ondersteunde parameters zijn:

filet =(invoer, vereist, tekenreeks)
naam van het invoerbestand waaruit moet worden geladen..

maskeren 2D-maskering, een van de twee invoerafbeeldingen moet van het type bit. zijn, ondersteund
parameters zijn:

vullen = min; dictaat
vulstijl voor pixels buiten het masker. Ondersteunde waarden zijn:
max ‐ stel waarden buiten het masker in op de maximale waarde gevonden in de
afbeelding..
nul ‐ stel de waarden buiten het masker in op nul.
Min ‐ stel waarden buiten het masker in op de minimumwaarde gevonden in de
afbeelding.

invoer =(invoer, vereist, tekenreeks)
tweede invoer afbeelding bestandsnaam.

omgekeerde = 0; boel
ingesteld op true om de inverse van het masker te gebruiken voor maskering.

maximale stroom Dit filter implementeert het gebruik van het max-flow min-cut-algoritme voor afbeeldingen
segmentatie, ondersteunde parameters zijn:

zink-stroom =(invoer, vereist, tekenreeks)
Afbeelding van het vlottertype om de stroom per pixel naar de sink te definiëren.

bronstroom =(invoer, vereist, tekenreeks)
Afbeelding van het float-type om de stroom per pixel naar de bron te definiëren.

gemiddelde 2D-beeldgemiddelde filter, ondersteunde parameters zijn:

w = 1; int in [1, inf)
halve filterbreedte.

mediaan Mediaanfilter voor 2D-afbeeldingen, ondersteunde parameters zijn:

w = 1; int in [1, inf)
halve filterbreedte.

mlv Gemiddelde van de minste variantie 2D-beeldfilter, ondersteunde parameters zijn:

w = 1; int in [1, inf)
parameter voor filterbreedte.

ngfnorm 2D-afbeelding naar genormaliseerd gradiëndveldnormfilter

(geen parameters)

lawaai 2D-beeldruisfilter: voeg additieve of gemoduleerde ruis toe aan een afbeelding, ondersteund
parameters zijn:

g = [gauss:mu=0,sigma=10]; fabriek
geluidsgenerator. Voor ondersteunde plug-ins zie PLUGINS:generator/noise

mod = 0; boel
additief of gemoduleerd geluid.

open morfologische open, ondersteunde parameters zijn:

zinspelen = zwart; set
een hint naar de hoofdinhoud van de afbeelding. Ondersteunde waarden zijn:( zwart, wit,
)

vorm = [bol:r=2]; fabriek
structurerend element. Voor ondersteunde plug-ins zie PLUGINS:2dimage/shape

snoeien Morfologisch snoeien. Snoeien tot convergentie zal alle pixels behalve wissen
gesloten lussen., ondersteunde parameters zijn:

iter = 0; int in [1, 1000000]
Aantal uit te voeren iteraties, 0=tot convergentie.

regiogroeien
Regio groeit vanaf een zaadje tot alleen langs toenemende gradiënten,
ondersteunde parameters zijn:

n = 8n; fabriek
Buurt vorm. Voor ondersteunde plug-ins zie PLUGINS:2dimage/shape

zaad =(invoer, vereist, tekenreeks)
zaadafbeelding (bit gewaardeerd).

zandp zout en peper 3D-filter, ondersteunde parameters zijn:

dorsen = 100; drijven in (0, inf)
drempelwaarde.

w = 1; int in [1, inf)
parameter voor filterbreedte.

schaal Downscale-filter voor 2D-afbeeldingen, ondersteunde parameters zijn:

interp = [bspline:d=3]; fabriek
te gebruiken interpolatiemethode. Voor ondersteunde plug-ins zie
PLUGINS: 1d/splinekernel

s = [[0,0]]; 2dgrenzen
doelgrootte als 2D-vector.

sx = 0; uint in [0, inf)
doelgrootte in x-richting, 0: gebruik invoergrootte.

sy = 0; uint in [0, inf)
doelgrootte in y-richting, 0: gebruik invoergrootte.

selecteer groot 2D-label selecteert het grootste componentfilter

(geen parameters)

sepconv 2D-beeldintensiteit afzonderlijk convolutiefilter, ondersteunde parameters zijn:

kx = [gauss:w=1]; fabriek
filterkernel in x-richting. Voor ondersteunde plug-ins zie
PLUGINS: 1d/spacialkernel

ky = [gauss:w=1]; fabriek
filterkernel in y-richting. Zie voor ondersteunde plug-ins
PLUGINS: 1d/spacialkernel

gemeen 2D-beeldfilter dat het gemiddelde over een bepaalde buurtvorm evalueert,
ondersteunde parameters zijn:

vorm = 8n; fabriek
buurtvorm om het gemiddelde te evalueren. Voor ondersteunde plug-ins zie
PLUGINS:2dbeeld/vorm

sobel Het 2D Sobel-filter voor gradiëntevaluatie. Houd er rekening mee dat het uitvoerpixeltype
de gefilterde afbeelding is hetzelfde als het type invoerpixel, waardoor de invoer wordt geconverteerd
vooraf naar een afbeelding met drijvende kommawaarde wordt aanbevolen., ondersteund
parameters zijn:

dir = x; dictaat
Gradiëntrichting. Ondersteunde waarden zijn:
y ‐ gradiënt in y-richting
x ‐ gradiënt in x-richting

sorteerlabel
Deze plug-in sorteert de labels van een grijswaardenafbeelding zodat het laagste label
waarde komt overeen met het label met de meeste pixels. De achtergrond (0) is dat niet
aangeraakt

(geen parameters)

vzmh gezaaide waterhoofd. Het algoritme extraheert precies zoveel regio's als initiaal
labels worden gegeven in de seed-afbeelding., ondersteunde parameters zijn:

Grad = 0; boel
Interpreteer het invoerbeeld als verloop. .

Mark = 0; boel
Markeer de gesegmenteerde stroomgebieden met een speciale grijsschaalwaarde.

n = [bol:r=1]; fabriek
Buurt voor waterschapsregio groeit. Voor ondersteunde plug-ins zie
PLUGINS:2dbeeld/vorm

zaad =(invoer, vereist, tekenreeks)
seed-invoerafbeelding met de labels voor de eerste regio's.

tee Sla de invoerafbeelding op in een bestand en geef deze ook door aan het volgende filter,
ondersteunde parameters zijn:

filet =(uitvoer, vereist, tekenreeks)
naam van het uitvoerbestand om de afbeelding ook op te slaan.

het verdunnen Morfologische verdunning. Uitdunnen tot convergentie zal resulteren in een 8-connected
skelet, ondersteunde parameters zijn:

iter = 0; int in [1, 1000000]
Aantal uit te voeren iteraties, 0=tot convergentie.

dorsen Dit filter zet alle pixels van een afbeelding op nul die onder een bepaalde waarde vallen
drempelwaarde en waarvan de buren in een bepaalde buurtvorm ook onder a vallen
deze drempel, ondersteunde parameters zijn:

vorm = 4n; fabriek
buurtvorm waarmee rekening moet worden gehouden. Voor ondersteunde plug-ins zie
PLUGINS:2dbeeld/vorm

dorsen = 5; dubbele
De drempelwaarde.

transformeren Transformeer de invoerafbeelding met de gegeven transformatie., ondersteunde parameters
zijn:

filet =(invoer, vereist, tekenreeks)
Naam van het bestand met de transformatie..

ws basis watershead segmentatie., ondersteunde parameters zijn:

evaluatie = 0; boel
Stel in op 1 als de invoerafbeelding geen gradiëntnormafbeelding vertegenwoordigt.

Mark = 0; boel
Markeer de gesegmenteerde stroomgebieden met een speciale grijsschaalwaarde.

n = [bol:r=1]; fabriek
Buurt voor waterschapsregio groeit. Voor ondersteunde plug-ins zie
PLUGINS:2dbeeld/vorm

dorsen = 0; zweven in [0, 1)
Relatieve gradiënt normdrempel. De werkelijke waarde drempelwaarde is
thresh * (max_grad - min_grad) + min_grad. Bassins gescheiden door hellingen
met een lagere norm zullen worden samengevoegd.

PLUG-INS: 2dbeeld/io

bmp BMP 2D-beeld input/output ondersteuning

Erkende bestandsextensies: .BMP, .bmp

Ondersteunde elementtypen:
binaire data, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit

datapool Virtuele IO van en naar de interne datapool

Erkende bestandsextensies: .@

dicom 2D-beeld io voor DICOM

Herkende bestandsextensies: .DCM, .dcm

Ondersteunde elementtypen:
ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit

EXR een 2dimage io-plug-in voor OpenEXR-afbeeldingen

Erkende bestandsextensies: .EXR, .exr

Ondersteunde elementtypen:
niet-ondertekende 32 bit, drijvende komma 32 bit

jpg een 2dimage io-plug-in voor jpeg-grijswaardenafbeeldingen

Erkende bestandsextensies: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Ondersteunde elementtypen:
niet-ondertekende 8 bit

png een 2dimage io-plug-in voor png-afbeeldingen

Erkende bestandsextensies: .PNG, .png

Ondersteunde elementtypen:
binaire data, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit

rauw Ondersteuning voor RAW 2D-beelduitvoer

Herkende bestandsextensies: .RAW, .raw

Ondersteunde elementtypen:
binaire gegevens, ondertekend 8 bit, niet ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit,
ondertekend 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
beetje

tif TIFF 2D-beeld invoer/uitvoer ondersteuning

Herkende bestandsextensies: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Ondersteunde elementtypen:
binaire data, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit, unsigned 32 bit

vergezicht een 2dimage io-plug-in voor vista-afbeeldingen

Erkende bestandsextensies: .V, .VISTA, .v, .vista

Ondersteunde elementtypen:
binaire gegevens, ondertekend 8 bit, niet ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit,
ondertekend 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
beetje

PLUG-INS: 2dbeeld/vorm

1n Een vorm die alleen het centrale punt bevat

(geen parameters)

4n 4n buurt 2D-vorm

(geen parameters)

8n 8n buurt 2D-vorm

(geen parameters)

rechthoek maker van een rechthoekig masker, ondersteunde parameters zijn:

vullen = 1; boel
maak een gevulde vorm.

Hoogte = 2; int in [1, inf)
hoogte rechthoek.

Breedte = 2; int in [1, inf)
breedte van de rechthoek.

bol Gesloten bolvormige buurtvorm met straal r. Ondersteunde parameters zijn:

r = 2; drijven in (0, inf)
bol straal.

vierkant maker van een vierkant masker, ondersteunde parameters zijn:

vullen = 1; boel
maak een gevulde vorm.

Breedte = 2; int in [1, inf)
breedte van de rechthoek.

PLUG-INS: 2dtransformatie/io

bbs Binaire (niet-draagbare) geserialiseerde IO van 2D-transformaties

Erkende bestandsextensies: .bbs

datapool Virtuele IO van en naar de interne datapool

Erkende bestandsextensies: .@

vergezicht Vista-opslag van 2D-transformaties

Herkende bestandsextensies: .v2dt

xml XML geserialiseerde IO van 2D-transformaties

Erkende bestandsextensies: .x2dt

PLUG-INS: generator/geluid

gauss Deze ruisgenerator creëert willekeurige waarden die worden verdeeld volgens a
Gaussien-distributie met behulp van de Box-Muller-transformatie., ondersteund
parameters zijn:

mu = 0; vlot
gemiddelde van distributie.

zaad = 0; uint in [0, inf)
stel willekeurig zaad in (0=init gebaseerd op systeemtijd).

sigma = 1; drijven in (0, inf)
standaardafleiding van distributie.

uniform Uniforme ruisgenerator met behulp van C stdlib rand(), ondersteunde parameters zijn:

a = 0; vlot
ondergrens bij ruisbereik.

b = 1; vlot
hogere grens bij ruisbereik.

zaad = 0; uint in [0, inf)
stel willekeurig zaad in (0=init gebaseerd op systeemtijd).

VOORBEELD

Evalueer het MAD-beeld van het selectiekader rond de segmentatie uit een reeks
segment.set na toepassing van een tijdelijk Gaussiaans filter met een breedte van 5. Geen ruimtelijke filtering
zal toegepast worden. Het selectiekader wordt in alle richtingen met 3 pixels vergroot. Winkel
de afbeelding in OpenEXR-formaat.

mia-2dseriessmoothgradMAD -i segment.set -o mad.exr -g 2 -c -e 3

AUTEUR(s)

Gert Wolny

COPYRIGHT

Op deze software rust copyright (c) 1999-2015 Leipzig, Duitsland en Madrid, Spanje. Het komt
met ABSOLUUT GEEN GARANTIE en u mag het herdistribueren onder de voorwaarden van de GNU
ALGEMENE PUBLIEKE LICENTIE Versie 3 (of later). Voer voor meer informatie het programma uit met de
optie '--copyright'.

Gebruik mia-2dseriessmoothgradMAD online met behulp van onworks.net-services