mincaverage - Online in de cloud

PROGRAMMA:

NAAM

mincaverage - gemiddelde minc-bestanden

KORTE INHOUD

mincagemiddelde [ ] .mnc [ .mnc...] .mnc

PRODUCTBESCHRIJVING

Minimaal gemiddelden minc-bestanden samen. Er is een reeks optionele gedragingen toegestaan, zoals
goed: volumes pre-normaliseren, een standaarddeviatievolume creëren, gemiddeld over een
opgegeven afmetingen van de invoerbestanden.

OPTIES

Houd er rekening mee dat opties in verkorte vorm kunnen worden opgegeven (zolang ze uniek zijn) en
kan overal op de opdrachtregel worden gegeven.

Algemeen opties

-2 Maak een uitvoerbestand in MINC 2.0-indeling.

-klodder
Een bestaand bestand overschrijven.

-geen klomp
Overschrijf een bestaand bestand niet (standaard).

-uitgebreid
Druk voortgangsinformatie af voor elk stuk gekopieerde gegevens (standaard).

-rustig Druk geen voortgangsinformatie af.

-debuggen Print extra informatie (bijvoorbeeld normalisatiefactoren).

-bestandslijst bestandsnaam
Geef een bestand op dat een lijst met invoerbestandsnamen bevat. Als "-" wordt gegeven, dan bestand
namen worden gelezen uit stdin. Als deze optie wordt gegeven, mag er geen invoer zijn
bestandsnamen die op de opdrachtregel zijn opgegeven. Lege regels in het invoerbestand zijn
buiten beschouwing gelaten.

-max_buffer_grootte_in_kb buffer grootte
Specificeer de maximale grootte van de interne buffers (in kbytes). Standaard is 4096
kbytes.

uitgang type dan: opties

Deze opties regelen de opslagprecisie en de grootte van individuele voxelwaarden in de
uitvoer bestand.

-bestandstype
Voer geen typeconversie uit (standaard).

-byte Schrijf 8-bit gehele waarden op.

-korte Schrijf 16-bit gehele waarden op.

-in Schrijf 32-bit gehele waarden op.

-lange Vervangen door -int.

-vlotter Schrijf drijvende-kommawaarden met enkele precisie op.

-dubbele
Schrijf drijvende-kommawaarden met dubbele precisie op.

-ondertekend Schrijf waarden op als gehele getallen met teken (standaard voor kort en lang). Genegeerd voor
drijvende-komma typen.

-ongetekend
Schrijf waarden uit als gehele getallen zonder teken (standaard voor byte). Genegeerd voor zwevend
soorten punten.

-bereik Min max
specificeert het geldige bereik van uitvoervoxelwaarden in hun gehele representatie.
Standaard is het volledige bereik voor het type en teken. Deze optie wordt genegeerd
drijvende-kommawaarden. Om enig effect te hebben, moet u een type opgeven.

middeling opties

-normaliseren
Normaliseer de volumes tot hun mondiale gemiddelde voordat u ze gaat middelen (op basis van het gemiddelde).
van voxels met een waarde groter dan 2 procent van het volledige bereik boven het minimum).

-nonormaliseren
Volumes niet normaliseren (standaard).

-sdbestand sdbestand.mnc
Geef de naam op van een uitvoerstandaarddeviatiebestand dat bovendien moet worden berekend
het gemiddelde dat normaal wordt berekend.

-gewichtbestand gewichtsbestand.mnc
Geef een cumulatief voxelgewichtbestand voor uitvoer op (standaard = geen).

-kopieer_header
Kopieer alle aanvullende headerinformatie uit het eerste invoerbestand (default
voor één invoerbestand).

-nocopy_header
Kopieer geen aanvullende headerinformatie (standaard voor veel invoerbestanden).

-gem.dim dimnaam
Geef de naam op van een dimensie waarover we het gemiddelde moeten nemen (of berekenen).
standaardafwijking). Als de normalisatie is voltooid, is dit nog steeds alleen van toepassing op gescheiden
alleen bestanden - er vindt geen normalisatie plaats binnen een bestand.

-binariseren
Binariseer de invoervolumes voordat u het gemiddelde berekent. De binarisering is voltooid
door een bereik van waarden op te geven die 1 bijdragen aan het gemiddelde. Normalisatie van
de invoer is niet toegestaan ​​bij het uitvoeren van binarisatie.

-binbereik Min max
Geef het waardenbereik voor binarisatie op.

-binwaarde waarde
Geef één wettelijke waarde (geheel getal) op voor binarisatie. Het bereik is ingesteld op +/-
0.5 rond deze waarde om een ​​effectieve afronding van de invoerwaarden te bereiken.

-negeer_hieronder waarde
Neem voxels onder deze waarde niet mee in het gemiddelde en de sd

-ignore_hierboven waarde
Neem voxels boven deze waarde niet mee in het gemiddelde en de sd

-verdieping waarde
synoniem voor -negeer_hieronder

-ignore_hierboven waarde
synoniem voor -ignore_hierboven

-gewichten
Geef een reeks gewichten op voor het middelen. Het aantal wegingswaarden moet
overeenkomen met het aantal invoerbestanden en de waarden moeten als één geheel worden opgegeven
argument met komma's of spaties als scheidingstekens. De som van de gewichten mag niet-
nul. Als gewichten worden gebruikt met een middelingsdimensie, kan slechts één invoerbestand dit doen
wees duidelijk.

-breedte_gewogen
Deze optie kan alleen worden gebruikt bij het middelen van een dimensie (-gem.dim keuze). Het
specificeert dat de weging moet worden uitgevoerd met behulp van de corresponderende breedtevariabele
naar de middelingsdimensie. Gebruik bijvoorbeeld -breedte_gewogen Met -gem.dim niet de tijd of
zal de tijdbreedtevariabele gebruiken om de waarden te wegen.

-min_gewicht waarde
Hier wordt het minimumgewicht aangegeven (aantal volumes als er geen gewichten zijn opgegeven)
nodig voor het berekenen van een geldig gemiddelde. Als het cumulatieve gewicht voor een voxel is
onder deze drempel zullen het gerapporteerde gemiddelde en de SD 0 zijn. Normaal gesproken is dit het geval
kan nuttig zijn als waarden worden uitgesloten met behulp van een van de -negeren opties, of op basis van NaN-waarden
in het (de) ingangsvolume(s).

-min_gewichtsfractie waarde
Hetzelfde als -min_gewicht, maar gespecificeerd als een fractie van de som van de invoergewichten
(of het aantal invoervolumes, als er geen gewicht is opgegeven).

Algemeen opties For allen commando's:

-Help Druk een samenvatting van de opdrachtregelopties af en sluit af.

-versie
Druk het versienummer van het programma af en sluit af.

Gebruik mincaverage online met behulp van onworks.net-services