Dit is de opdracht xtractore die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
xtractore - extraheer reeksen die overeenkomen met geannoteerde kenmerken uit de gegeven reeks
filet
KORTE INHOUD
extratractor [opties] kenmerken.gff3 sequenties.fasta
PRODUCTBESCHRIJVING
Opties:
-d|--debuggen
foutopsporingsuitvoer afdrukken
-h|--help
druk dit helpbericht af en sluit af
-i|--id-bestand: BESTAND
bestand met een lijst met feature-ID's (1 per regel zonder spaties); indien verstrekt,
alleen objecten met ID's in dit bestand worden geëxtraheerd
-o|--outfile: BESTAND
bestand waarnaar uitvoerreeksen zullen worden geschreven; standaard is terminal (stdout)
-t|--type: STRING
functietype om te extraheren; kan meerdere keren worden gebruikt om kenmerken van meerdere te extraheren
types
-v|--versie
versienummer afdrukken en afsluiten
-V|-- uitgebreid
uitgebreide waarschuwings- en foutmeldingen afdrukken
-w|--breedte: INT
breedte van elke reeks reeksen in de Fasta-uitvoer; standaard is 80; ingesteld op 0 voor nee
opmaak
Gebruik xtractore online met behulp van onworks.net-services
