Dit is de Linux-app genaamd bspipe waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als bspipe-1.3.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app genaamd bspipe gratis online uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
bspijp
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
BSpipe is een uitgebreide pijplijn van sequentiekwaliteitscontrole en mapping tot functionele analyse van differentieel gemethyleerde regio's:
(1) kwaliteitsbeoordeling van de volgorde,
(2) volgordereiniging,
(3) sequentie-leestoewijzing,
(4) kwantificering van methylatie,
(4) monstervergelijkingen op basis van methylatieprofiel,
(5) identificatie van DMR's (differentieel gemethyleerde regio's),
(6) annotatie van DMR's,
(7) functionele analyse van differentieel gemethyleerde genen,
(8) het genereren van invoerbestanden voor visualisatie, en
(9) ondersteuning voor geavanceerde sequencing-technologieën zoals TAB-seq, OxBS-seq, MAP-it en NOMe-seq.
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
Unix Shell, Perl, S/R
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/bspipe/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
